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chenyanzhen鐵蟲 (小有名氣)
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測(cè)序后發(fā)現(xiàn)堿基不一樣了 已有5人參與
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構(gòu)建質(zhì)粒成功后去生工測(cè)序，測(cè)序結(jié)果中CCTCAGTGAGATTGTAGTGCTTGCTTAACAATGGGTTTTGGCTGCAAGTGCAATAATTCTTGCTTTGTGTGCCAGTTTTTATGTGGACATTTGATTACCTTTGCAC 變成了CCTCAGTGAGATTGTAGTGCTTGCTTAACAATGGGTTTTGGCTGCAAGTGCAATAATTCTTGCTTTGTGTGCCCGTTTTTATGTGGACATTTGATTACCTTTGCAC.在nvbi中對(duì)這兩條序列進(jìn)行BLAST，發(fā)現(xiàn)英文名稱不一樣，我要的是塔瑪亞歷山大藻四型，出現(xiàn)這種結(jié)果該怎么辦��？ |
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wangranjun
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2樓2014-08-15 17:10:02
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
chenyanzhen(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+1, 鼓勵(lì)回帖交流 2014-08-19 20:38:46
| 測(cè)序是允許錯(cuò)誤的，一般都有一點(diǎn)點(diǎn)錯(cuò)誤率的哦，這個(gè)很正常的。你去生工測(cè)序，一般都是很多很多個(gè)單一起跑一個(gè)半導(dǎo)體芯片（二代測(cè)序），這個(gè)錯(cuò)誤肯定不能避免的，一般不會(huì)給你再做一次毛細(xì)管電泳的。本來就便宜，做了不虧本哇。大家都這樣過來的。一個(gè)堿基而已哇。 |
4樓2014-08-16 22:48:32
落葉的軌跡
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chenyanzhen
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7樓2014-08-18 18:29:23
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8樓2014-08-19 06:49:50
【答案】應(yīng)助回帖
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chenyanzhen(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+1, 鼓勵(lì)回帖交流 2014-08-19 20:39:23
chenyanzhen(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+1, 鼓勵(lì)回帖交流 2014-08-19 20:39:23
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你送檢什么樣品？ 二代測(cè)序通量太高，做這種質(zhì)粒測(cè)序，我還沒有聽二代測(cè)序有成本優(yōu)勢(shì)的。我們?cè)?jīng)評(píng)估過MiSeq做一代測(cè)序樣品的測(cè)序成本，遠(yuǎn)高于現(xiàn)有的一代測(cè)序。 二代測(cè)序結(jié)果，用一代測(cè)序驗(yàn)證，這個(gè)很常見。但是能用一代測(cè)序解決的，先用二代測(cè)序做，還請(qǐng)你具體講一下。 |
9樓2014-08-19 19:34:42
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