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lywachieve至尊木蟲 (著名寫手)
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[求助]
急 分子克隆遇到問題
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目前一直在做酶分子的定向進(jìn)化,但是所做分子克隆部分三個(gè)月以來一直不成功;因?yàn)檫@是后續(xù)試驗(yàn)基礎(chǔ),懇請大家提出寶貴建議,不勝感激; 本人是應(yīng)用易錯(cuò)PCR方法改造目的基因;即通過改變PCR體系中各組分的比例如Mg離子濃度,添加Mn離子等,模擬自然進(jìn)化引入錯(cuò)配堿基,從而改變酶的性狀。而在此之前已有公司合成載體PET-24a-atsA-N-6His;(即公司已經(jīng)把目的片段全長與載體連接完成);而導(dǎo)師的計(jì)劃是先改造目的片段的控制水解酶性狀的一部分(即目的片段部分長度);由公司設(shè)計(jì)針對此部分片段的引物;本人進(jìn)行易錯(cuò)PCR,再對此PCR片段和載體進(jìn)行雙酶切,酶切位點(diǎn)單一,均為粘性末端(NEB公司內(nèi)切酶;載體和片段同步雙酶切,37度雙酶同時(shí)切2h),酶切后電泳驗(yàn)證;載體膠回收純化(此時(shí)載體已去除了待突變片段,但仍含有控制該酶其他性狀的基因);目的片段用PCR產(chǎn)物回收試劑盒回收純化(只切掉56bp);純化均采用捷瑞試劑盒;載體切8ug回收十幾ng/ul約20ul量;目的片段且2ug;回收約20-30ng/ul約30ul量;連接時(shí)用TakaRa 的T4 ;比例從1:3-1:10都試過;10ul-20ul化轉(zhuǎn)入商品化DH5a 都無菌落產(chǎn)生,(抗生素抗性無問題,也沒有失效);加倍T4量后有少量菌落,但菌落PCR均無目的條帶出現(xiàn);(菌落PCR體系無問題,以用商品化原質(zhì)粒轉(zhuǎn)化后挑取單克隆驗(yàn)證有目的條帶。) 為探究原因,做以下實(shí)驗(yàn): 1.針對待突變部分基因做常規(guī)PCR,測序示無突變,再依上述方法酶切連接,轉(zhuǎn)化,仍未有菌落長出; 2.突變目的片段后膠回收純化,PMD-T19連接測序;刮取平板,混提質(zhì)粒,雙酶切目的片段,以之前切取純化后的目的片段對照,膠回收純化目的片段;再與雙酶切后載體T4連接,轉(zhuǎn)化商品化DH5a;仍無菌落長出;(連T載體測序示突變未導(dǎo)致酶切位點(diǎn)改變)。 另外,因相關(guān)文獻(xiàn)鮮有報(bào)道只突變目的片段一部分再重組,而往往是針對目的片段全長突變;不知這一點(diǎn)對分子克隆有無影響? 可請各位專家予以指導(dǎo),不勝感激。 |

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