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jk射手座新蟲 (著名寫手)
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[求助]
求助一個關(guān)于Linux下的VASP故障的問題 已有1人參與
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首先描述一下前幾天我碰到的問題：我用的是曙光服務(wù)器，其共有16個節(jié)點（相當于是16個主機吧），安裝的5.的VASP軟件，好像是可以直接調(diào)用的那種（說不太清，師兄告知這是別人幫忙安裝的）。那天因為些異常原因網(wǎng)絡(luò)升級，服務(wù)器斷網(wǎng)，需要重啟；但是這樣一次災(zāi)難性的重啟導(dǎo)致我里面的數(shù)據(jù)全部丟失，包括往屆的師兄做的東西；另外更棘手的是VASP軟件不能正常運行，我平時用的節(jié)點 有 3,4,7,8,9,11,12,14，16共9個節(jié)點，每次通過SSH遠程客戶端登陸終端是直接登上的16節(jié)點；如果ssh node轉(zhuǎn)換到其它節(jié)點上時，會提示： -bash: /public/software/intel/bin/iccvars.sh: 娌℃椋涓浠舵玨? -bash: /public/software/intel/bin/ifortvars.sh: 娌℃椋涓浠舵玨? 其中后邊那幾個亂碼意思是找不到該文件； 我給曙光的售后維修部電話咨詢過，通過描述他們說應(yīng)該不是服務(wù)器硬件的問題；我猜測可能是因為在重啟的時候我冷啟動了控制服務(wù)器的那臺電腦主機的按鈕，不然我實在是想不出是哪步出錯能讓linux 系統(tǒng)里的那些血汗數(shù)據(jù)丟失（幸虧有一些備份）；因為以前在需要重啟的時候，沒有一次出現(xiàn)這么慘重的狀況； 出現(xiàn)故障后，打算重新編譯VASP重新補算一些東西，學(xué)習(xí)編譯安裝的過程中，我發(fā)現(xiàn)16節(jié)點，也就是剛登陸就登上的那個終端可以進行計算了，只是登陸時SSH上還會顯示上面那兩條提示說 iccvars.sh ifortvars.sh找不到（這兩個好像是編譯器的文件），但是ssh node換到其他節(jié)點依然計算不了，這一系列的問題下來搞得我這個工科非計算機的屌絲蒙了又蒙，周圍沒有人懂這個東西； 發(fā)此貼也是想碰碰運氣，看看有沒有人能想到一些端倪，（當然我也知道我的描述挺亂的，沒辦法，這問題本身就夠讓我蒙的了）因為目前我感覺好像是應(yīng)該在服務(wù)器那邊設(shè)置什么東西，讓其他8個節(jié)點與16節(jié)點的東西共享，這樣都可以算；或者是丟失那些數(shù)據(jù)的同時丟失了什么編譯器之類的根文件，挨個節(jié)點重新安裝一下應(yīng)該就能好；但是這些我都無從下手； 現(xiàn)在是只有一個節(jié)點在跑我剩余的任務(wù)，可是還是想能把服務(wù)器的這個毛病搞好，求大神指點！阿彌陀佛  |
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jk射手座
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2樓2014-09-11 15:30:51
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十分感謝你的回復(fù)！ 首先那個目錄在出問題之后我就查了，確實沒了，那兩個 ifortvars.sh iccvars.sh 也沒有了，我以前查看過，在linux系統(tǒng)里是和vasp一樣的圖標，所以我猜應(yīng)該也是什么程序軟件的東西。 剛才照您說的df了一下，顯示是這樣的 [root@node16 ~]# df Filesystem 1K-blocks Used Available Use% Mounted on /dev/sdb3 134041452 21086912 106035748 17% / /dev/sdb1 101086 64468 31399 68% /boot tmpfs 3903896 0 3903896 0% /dev/shm 這個是在16節(jié)點上出來的信息，換了其它節(jié)點，比如8節(jié)點： [root@node8 ~]# df 驛歡緋葷? 1K-? 宸茬? 瀵紼 宸茬? 驊澆綣 /dev/mapper/VolGroup00-LogVol00 128806444 5692620 116465200 5% / /dev/sda1 101086 12784 83083 14% /boot tmpfs 4123096 0 4123096 0% /dev/shm 是這樣的，亂碼就是Filesystem 1K-blocks Used Available Use% Mounted on 翻譯過來的漢字；（在控制服務(wù)器的那臺主機上查看能看到是漢字，這個亂碼是我通過SSH遠程客戶端查看的，會顯示出亂碼）；其它的節(jié)點df出來的東西基本是一樣的，只是Used那一列數(shù)據(jù)有差異； 不過這么看的話，好像其它8個的節(jié)點的這些數(shù)據(jù)差不多都比16節(jié)點的小啊。。請問這個是說明了什么？ |
4樓2014-09-12 09:21:22
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嗯我用了下，16節(jié)點的顯示的是： [root@node16 1.5]# cat /etc/fstab LABEL=/ / ext3 defaults 1 1 LABEL=/boot /boot ext3 defaults 1 2 tmpfs /dev/shm tmpfs defaults 0 0 devpts /dev/pts devpts gid=5,mode=620 0 0 sysfs /sys sysfs defaults 0 0 proc /proc proc defaults 0 0 LABEL=SWAP-sda2 swap swap defaults 0 0 其它的我試了下3 和8節(jié)點，是這樣的： [root@node8 ~]# cat /etc/fstab /dev/VolGroup00/LogVol00 / ext3 defaults 1 1 LABEL=/boot /boot ext3 defaults 1 2 tmpfs /dev/shm tmpfs defaults 0 0 devpts /dev/pts devpts gid=5,mode=620 0 0 sysfs /sys sysfs defaults 0 0 proc /proc proc defaults 0 0 /dev/VolGroup00/LogVol01 swap swap defaults 0 0 好像沒太大區(qū)別。話說，150G硬盤是怎么看出來的？cluster代表的什么呀，門外漢表示看不懂鴨梨很大  |
6樓2014-09-12 20:19:25
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7樓2014-09-14 16:48:01
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