 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2775 | 回復(fù): 5 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
蘭花草翠翠新蟲 (初入文壇)
|
[求助]
QM/MM 和ONIOM 已有1人參與
|
||
| 請(qǐng)問 QM/MM和ONIOM什么關(guān)系 我看的文獻(xiàn)說ONIOM（B3LYP/6-31G:UFF），這括號(hào)里面的第一項(xiàng)是用量子力學(xué)（QM）在B3LYP/6-31G水平計(jì)算，用分子力學(xué)方法（MM）在UFF水平上計(jì)算。。。我說的對(duì)嗎？也就是UFF是分子力學(xué)范疇？還有文獻(xiàn)說分層計(jì)算在QM和 classical dynamics兩方面連用，經(jīng)典力學(xué)是不是就是指的MM分子力學(xué)呢？ |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 經(jīng)驗(yàn) |
» 猜你喜歡
基金正文30頁指的是報(bào)告正文還是整個(gè)申請(qǐng)書
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
誠邀有志之士加入江蘇大學(xué)環(huán)境學(xué)院合成生物學(xué)課題組！(長期接收學(xué)碩專碩、碩博連讀)
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有152人回復(fù)
-
研究生招生
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
一志愿南大理論與計(jì)算化學(xué)方向（070300）342分，求調(diào)劑
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
歡迎化學(xué)、化工、物理、材料、或計(jì)算機(jī)背景的考研咨詢
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
哈爾濱工業(yè)大學(xué)（深圳）綠色化學(xué)團(tuán)隊(duì)招收2026年秋季入學(xué)博士生
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
澳大利亞昆士蘭科技大學(xué)PhD博士獎(jiǎng)學(xué)金
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
山西大學(xué)資源與環(huán)境工程研究所化工分離/環(huán)境功能材料小組招收2026年博士生
已經(jīng)有2人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 用高斯QM/MM算頻率和QST3
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 用amber制作小分子力場(chǎng)參數(shù)時(shí)突然遇到的一些問題
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 使用amber力場(chǎng)，一些參數(shù)無法獲得
已經(jīng)有5人回復(fù)
- QM/MM和QMCF方法原理
已經(jīng)有9人回復(fù)
- QM/MM計(jì)算中如何添加Pb的amber力場(chǎng)參數(shù)？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- Gaussian的oniom計(jì)算中固定MM區(qū)優(yōu)化報(bào)錯(cuò)
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 使用Amber進(jìn)行QM/MM動(dòng)力學(xué)模擬
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 關(guān)于amber動(dòng)力學(xué)模擬中MM/GBSA的問題
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 買來的鈦片怎樣切割成小片呢，0.25 mm ，150 × 150 mm
已經(jīng)有20人回復(fù)
- 關(guān)于熵變的計(jì)算，有人知道怎么計(jì)算大的體系的熵變嗎？比如將近一千個(gè)殘基的體系？
已經(jīng)有11人回復(fù)
- AMBER中qm/mm的問題
已經(jīng)有5人回復(fù)
- [求助]QM/MM聯(lián)用
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】chemshell是商業(yè)軟件嗎
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助】使用gaussian的oniom+amber的時(shí)候出現(xiàn)錯(cuò)誤
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 重獎(jiǎng)?wù)骷瘒鴥?nèi)國外做理論計(jì)算課題組的信息
已經(jīng)有44人回復(fù)
- 【求助】GV輸出的Oniom輸入文件如何修改
已經(jīng)有17人回復(fù)
蘭花草翠翠
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 0.3
- 帖子: 43
- 在線: 33.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 2539855
- 注冊(cè): 2013-07-10
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
3樓2014-09-28 23:40:15
hairan
木蟲 (著名寫手)
瞌睡木蟲
- QC強(qiáng)帖: 3
- 應(yīng)助: 61 (初中生)
- 貴賓: 1.06
- 金幣: 4974.3
- 散金: 8072
- 紅花: 44
- 帖子: 2901
- 在線: 733.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 432069
- 注冊(cè): 2007-08-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhou2009: 金幣+5 2014-09-28 16:34:50
蘭花草翠翠: 金幣+5, ★★★很有幫助 2014-10-10 15:15:58
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhou2009: 金幣+5 2014-09-28 16:34:50
蘭花草翠翠: 金幣+5, ★★★很有幫助 2014-10-10 15:15:58
|
QM/MM和Gaussian的ONIOM有聯(lián)系，又有區(qū)別。 1、傳統(tǒng)的QM/MM必須是一部分使用量子化學(xué)方法（QM），另一部分使用分子力學(xué)方法（MM），但是對(duì)于Gaussian的ONIOM方法，在不考慮計(jì)算資源承受能力的情況下，可以對(duì)任何一部分使用任何一種Gaussian軟件支持的方法。 2、傳統(tǒng)的QM/MM方法使用一般只能將體系分成2各部分（或者叫層次），而ONIOM可以將體系分成三個(gè)層次，結(jié)果更加精細(xì)。 3、傳統(tǒng)的QM/MM方法對(duì)體系的優(yōu)化過程中，對(duì)每個(gè)部分的優(yōu)化是在該部分對(duì)應(yīng)的勢(shì)能面上進(jìn)行的，而ONIOM的優(yōu)化是將所有部分作為一個(gè)整體，優(yōu)化過程是在整體的勢(shì)能面上進(jìn)行了。 MM是Molecular Mechanics的簡寫，你在文獻(xiàn)上看到的molecular dynamics (MD)說的是分子動(dòng)力學(xué)，MM指的是一類計(jì)算能量的方法，而MD是一類研究體系動(dòng)態(tài)過程或者體系系綜平均的算法。MD可以基于MM，也可以基于QM。 文獻(xiàn)上的ONIOM(B3LYP/6-31G:UFF)的意思是這是一個(gè)兩層ONIOM計(jì)算，對(duì)定義為High的那一層使用量子化學(xué)方法B3LYP/6-31G來計(jì)算，而對(duì)定義為Low的那一層使用分子力學(xué)力場(chǎng)UFF來算。 |
2樓2014-09-28 01:10:50
lastzealot
新蟲 (著名寫手)
【亂世的奸雄】
- 應(yīng)助: 87 (初中生)
- 金幣: 2684.9
- 散金: 876
- 紅花: 24
- 帖子: 2920
- 在線: 212.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 730090
- 注冊(cè): 2009-03-24
- 性別: GG
- 專業(yè): 高分子材料結(jié)構(gòu)與性能
4樓2015-10-01 20:27:22
hairan
木蟲 (著名寫手)
瞌睡木蟲
- QC強(qiáng)帖: 3
- 應(yīng)助: 61 (初中生)
- 貴賓: 1.06
- 金幣: 4974.3
- 散金: 8072
- 紅花: 44
- 帖子: 2901
- 在線: 733.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 432069
- 注冊(cè): 2007-08-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
5樓2015-10-02 16:10:25
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 085700資源與環(huán)境308求調(diào)劑 +6 | 墨墨漠 2026-03-18 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研]
 320求調(diào)劑0856
+3
|
不想起名字112 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +8 | 何潤采123 2026-03-18 | 10/500 |
|
|
|
[考博] 東華理工大學(xué)化材專業(yè)26屆碩士博士申請(qǐng) +8 | zlingli 2026-03-13 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 能源材料化學(xué)課題組招收碩士研究生8-10名 +4 | 脫穎而出 2026-03-16 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 招收調(diào)劑碩士 +4 | lidianxing 2026-03-19 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 本人考085602 化學(xué)工程 專碩 +17 | 不知道叫什么！ 2026-03-15 | 19/950 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +3 | 曼殊2266 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +3 | 申子申申 2026-03-19 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 281求調(diào)劑（0805） +9 | 煙汐憶海 2026-03-16 | 19/950 |
|
|
|
[考研] 346求調(diào)劑[0856] +3 | WayneLim327 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿天大材料與化工（085600）總分338 +5 | 蔡大美女 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[教師之家] 焦慮 +9 | 水冰月月野兔 2026-03-13 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 材料專碩英一數(shù)二306 +5 | z1z2z3879 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +6 | 司空. 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 331求調(diào)劑（0703有機(jī)化學(xué) +7 | ZY-05 2026-03-13 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)336分求調(diào)劑 +6 | zbzihdhd 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 278求調(diào)劑 +5 | 煙火先于春 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 上岸的小葡 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 318求調(diào)劑 +3 | Yanyali 2026-03-15 | 3/150 |
|