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河外生命木蟲 (小有名氣)
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用autodock對接能否不指定柔性殘基 已有1人參與
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我在用autodock4.2進(jìn)行分子對接時遇到這樣一個難題:活性中心是在鐵卟啉環(huán)中間的三價鐵離子上,理論上這個Fe3+應(yīng)該是對接的中心。而autodock里柔性殘基一般都應(yīng)該是氨基酸,這樣我就沒辦法把Fe3+設(shè)為柔性的。在這樣的情況下,我能不能不指定柔性殘基,只是進(jìn)行剛性對接? 求高人指教,謝謝! |

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