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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » PCR相關 » 請教一些共顯性的標記問題
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chtao0924新蟲 (初入文壇)
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請教一些共顯性的標記問題 已有1人參與
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共顯性是指能同時表達的一對等位基因，微衛(wèi)星中擴增的不是都是基本與基因表達無關的重復序列嗎，而PCR的模板鏈為雙鏈DNA分子，其上面應該是只有一對等位基因的其中一個基因（比如A或者a），為什么泳道中會有兩條帶，并且可以判斷其為雜合子，一條帶的時候為純合子？ 因為初學，看了些pcr的原理，我是不是有什么概念上的東西搞錯了？請大家不吝賜教，謝謝！ |
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【答案】應助回帖
感謝參與，應助指數(shù) +1
LZ需要惡補相關知識 。首先，擴增出來的條帶不一定是與基因表達無關的，如果擴增片段在基因的外顯子里面（EST序列），就很可能與表達密切相關；第二，PCR模板為雙鏈DNA分沒錯，但是理想狀態(tài)下SSR擴增的條代并不是來自同一DNA分子（或者說同一條染色體），而是分別來自兩條（二倍體）或多條（多倍體）不同的染色體（同源染色體，半數(shù)來自父本，半數(shù)來自母本）。如果來自父本的染色體上的DNA序列與來自母本的對應位點的序列相同，則擴增出來體現(xiàn)為一條帶（即純合子），反之如來自父本的DNA對應位點與母本的不同，則體現(xiàn)為兩條帶（即雜合子）。 |
2樓2014-10-17 22:29:45
badman20
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chtao0924: 金幣+5, ★★★很有幫助, 非常感謝，了解了 2014-10-18 10:54:05
chtao0924: 金幣+5, ★★★很有幫助, 非常感謝，了解了 2014-10-18 10:54:05
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首先，SSR只是一個區(qū)分個體的標記，不一定直接與基因相關，如果SSR位于非編碼區(qū)，則SSR重復次數(shù)的變化可能不影響基因的功能表達，但是如果SSR位于基因編碼區(qū)，那么顯然SSR重復次數(shù)的變異會影響到基因編碼蛋白的序列，就與基因表達直接相關。第二，如果你研究的材料（生物體）是二倍體（比如人），那么擴增出來的條帶只有1條（純合子）或2條帶（雜合子），但如果材料為多倍體，比如很多植物（如小麥（六倍體）、馬鈴薯（四倍體）等）擴增出來的條帶可能就會有多個條帶。 |
5樓2014-10-18 08:44:08
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6樓2014-10-18 08:55:10
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3樓2014-10-17 22:53:08
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4樓2014-10-17 23:03:11
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7樓2016-01-22 19:53:28
8樓2016-01-22 22:56:26
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謝謝，那這樣的話，是不是只有與目的片段長度相同或者相近的地方的片段才是我們數(shù)據(jù)分析要分析的？其他擴增片段長度相差太大的就是可以舍棄的？但是有的個體目的片段長度附近會有3，4條帶，怎么分析呢？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
9樓2016-01-22 23:03:42
badman20
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10樓2016-01-23 10:00:54
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