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chtao0924新蟲 (初入文壇)
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[求助]
請(qǐng)教一些共顯性的標(biāo)記問(wèn)題 已有1人參與
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共顯性是指能同時(shí)表達(dá)的一對(duì)等位基因,微衛(wèi)星中擴(kuò)增的不是都是基本與基因表達(dá)無(wú)關(guān)的重復(fù)序列嗎,而PCR的模板鏈為雙鏈DNA分子,其上面應(yīng)該是只有一對(duì)等位基因的其中一個(gè)基因(比如A或者a),為什么泳道中會(huì)有兩條帶,并且可以判斷其為雜合子,一條帶的時(shí)候?yàn)榧兒献樱?br />
因?yàn)槌鯇W(xué),看了些pcr的原理,我是不是有什么概念上的東西搞錯(cuò)了?請(qǐng)大家不吝賜教,謝謝! |
新蟲 (初入文壇)
木蟲 (小有名氣)
LZ需要惡補(bǔ)相關(guān)知識(shí) 。首先,擴(kuò)增出來(lái)的條帶不一定是與基因表達(dá)無(wú)關(guān)的,如果擴(kuò)增片段在基因的外顯子里面(EST序列),就很可能與表達(dá)密切相關(guān);第二,PCR模板為雙鏈DNA分沒(méi)錯(cuò),但是理想狀態(tài)下SSR擴(kuò)增的條代并不是來(lái)自同一DNA分子(或者說(shuō)同一條染色體),而是分別來(lái)自兩條(二倍體)或多條(多倍體)不同的染色體(同源染色體,半數(shù)來(lái)自父本,半數(shù)來(lái)自母本)。如果來(lái)自父本的染色體上的DNA序列與來(lái)自母本的對(duì)應(yīng)位點(diǎn)的序列相同,則擴(kuò)增出來(lái)體現(xiàn)為一條帶(即純合子),反之如來(lái)自父本的DNA對(duì)應(yīng)位點(diǎn)與母本的不同,則體現(xiàn)為兩條帶(即雜合子)。 |
新蟲 (初入文壇)
木蟲 (小有名氣)
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首先,SSR只是一個(gè)區(qū)分個(gè)體的標(biāo)記,不一定直接與基因相關(guān),如果SSR位于非編碼區(qū),則SSR重復(fù)次數(shù)的變化可能不影響基因的功能表達(dá),但是如果SSR位于基因編碼區(qū),那么顯然SSR重復(fù)次數(shù)的變異會(huì)影響到基因編碼蛋白的序列,就與基因表達(dá)直接相關(guān)。第二,如果你研究的材料(生物體)是二倍體(比如人),那么擴(kuò)增出來(lái)的條帶只有1條(純合子)或2條帶(雜合子),但如果材料為多倍體,比如很多植物(如小麥(六倍體)、馬鈴薯(四倍體)等)擴(kuò)增出來(lái)的條帶可能就會(huì)有多個(gè)條帶。 |
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