 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2186 | 回復(fù): 8 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
孫1986金蟲 (正式寫手)
|
[交流]
高斯大俠留步，看看這個(gè)高斯輸入文件有何問題？
|
||
|
#p fopt=(ts z-matrix,calcfc) iop(5/13=1,1/11=1) freq optcyc=500 scf(maxcyc=300) ub3lyp/6-31g(d,p) geom=connectivity NO+CH2 reaction 0 2 N 0.00000000 0.00000000 -0.61797712 O 0.00000000 0.00000000 0.54072998 C 1.31900152 -1.04941686 -1.22943436 H 1.31900152 -0.05250786 -1.64471336 H 1.31900152 -2.04632586 -1.64471336 1 2 2.0 2 3 4 1.0 5 1.0 4 5 自己為高斯菜鳥，現(xiàn)在初學(xué)階段，模擬別人的結(jié)果，輸入這樣一個(gè)文件，有錯(cuò)誤，請(qǐng)哪位大俠指導(dǎo)一二 |
回復(fù)此樓» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
syhu_007012» 猜你喜歡
一志愿南大理論與計(jì)算化學(xué)方向（070300）342分，求調(diào)劑
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
歡迎化學(xué)、化工、物理、材料、或計(jì)算機(jī)背景的考研咨詢
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有180人回復(fù)
-
哈爾濱工業(yè)大學(xué)（深圳）綠色化學(xué)團(tuán)隊(duì)招收2026年秋季入學(xué)博士生
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
澳大利亞昆士蘭科技大學(xué)PhD博士獎(jiǎng)學(xué)金
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
【211博士招生】環(huán)境化學(xué)、地學(xué)、毒理方向，擅長污染物遷移轉(zhuǎn)化降解、計(jì)算模擬者優(yōu)先
已經(jīng)有17人回復(fù)
-
求助如何利用vasp計(jì)算磁光克爾效應(yīng)
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
070300總分298求調(diào)劑
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
一志愿廈門大學(xué)化學(xué)學(xué)碩307求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
理論與計(jì)算化學(xué)方向調(diào)劑——初試388分（數(shù)學(xué)144）
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 求助高斯文件輸入
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 知道贗勢基組Hay-Wadt VDZ (n+1) ECP和原子坐標(biāo)，怎樣寫高斯的幾何優(yōu)化輸入文件
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 怎樣在linux系統(tǒng)上提交高斯的輸入文件，運(yùn)算已經(jīng)查看輸出文件
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 請(qǐng)問如何在高斯的結(jié)果文件里找到HOMO和LUMO的能量？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 高斯rwf文件的大小，是隨計(jì)算增大，還是事先就分配好的？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 求助高斯輸出文件中坐標(biāo)系怎么定義的？
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 新手求助，高斯計(jì)算出現(xiàn)問題~
已經(jīng)有22人回復(fù)
- 新手求助高斯輸入文件寫法，求大神幫忙
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 關(guān)于高斯PCM模型輸入問題
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 同一個(gè)輸入文件，用windows版的高斯和linux版的高斯分別計(jì)算，怎么計(jì)算結(jié)果不一致？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 高斯l9999錯(cuò)誤 不收斂怎么辦？（有圖有真相，大家?guī)涂纯矗?/a>
已經(jīng)有31人回復(fù)
- 優(yōu)化好的分子結(jié)構(gòu)，用gaussview打開后保存為高斯輸入文件，再用該文件做TD，對(duì)嗎
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 高斯輸出文件轉(zhuǎn)化為mol2文件時(shí)出現(xiàn)問題 -c resp 與 -c bcc
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 急急急！高斯生成不了wfn文件怎么辦
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 晶體數(shù)據(jù)庫找到的分子晶體結(jié)構(gòu)怎么轉(zhuǎn)化成高斯輸入文件呢
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 為什么一計(jì)算就會(huì)出現(xiàn)系統(tǒng)找不到指定文件呢？求高斯大神解答啊....
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 有個(gè)求解微分方程用到高斯賽德爾迭代的，算不太明白啊，各位幫忙看看
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 請(qǐng)教各位大俠，高斯技術(shù)部的回復(fù)�？刂齐娮优挪架壍赖木唧w操作如何執(zhí)行？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【資源】如何閱讀高斯的計(jì)算輸出文件
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】運(yùn)行高斯-找不到輸入文件？？？？
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【求助】高斯b3lyp/VDZ的輸入文件寫法
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【求助】各位大哥，請(qǐng)問怎么看高斯的輸出文件？
已經(jīng)有12人回復(fù)
meteoric30
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 43 (小學(xué)生)
- 金幣: 1719.5
- 散金: 12
- 紅花: 2
- 帖子: 436
- 在線: 320.7小時(shí)
- 蟲號(hào): 1046846
- 注冊(cè): 2010-06-24
- 性別: GG
- 專業(yè): 催化化學(xué)
3樓2014-10-23 03:43:31
xieshen0321
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 4406.6
- 散金: 137
- 紅花: 3
- 帖子: 784
- 在線: 341.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 2052932
- 注冊(cè): 2012-10-10
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
2樓2014-10-22 21:38:53
阿Q~~
至尊木蟲 (文壇精英)
- 應(yīng)助: 77 (初中生)
- 金幣: 33343.6
- 紅花: 107
- 帖子: 36186
- 在線: 1028.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 3237212
- 注冊(cè): 2014-05-27
- 性別: MM
- 專業(yè): 宇宙學(xué)
4樓2014-10-23 06:49:21
高斯技術(shù)支持
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 10 (幼兒園)
- 金幣: 192.8
- 紅花: 2
- 帖子: 30
- 在線: 375.5小時(shí)
- 蟲號(hào): 3492706
- 注冊(cè): 2014-10-23
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
孫1986: 金幣+10, 您的解說受益匪淺 2014-10-23 11:11:18
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
孫1986: 金幣+10, 您的解說受益匪淺 2014-10-23 11:11:18
|
該例子有一定的典型性，有很多高斯初學(xué)者會(huì)遇到的問題，在此詳細(xì)討論一下： 首先，這個(gè)輸入文件可以運(yùn)行，但是容易導(dǎo)致錯(cuò)誤意想不到的結(jié)果 （1）當(dāng)給出opt=z-matrix時(shí)，高斯會(huì)去讀取輸入文件中的Z-matrix以及變量。可是樓主給出的是直角坐標(biāo)(cartesian)，所以程序會(huì)按照opt=cartesian來進(jìn)行優(yōu)化。參考http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_opt.htm （When a Z-matrix without any variables is used for the molecule specification, and Opt=Z-matrix is specified, then the optimization will actually be performed in Cartesian coordinates.） 使用該方法(opt=cartesian)收斂速度遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于默認(rèn)的冗余內(nèi)坐標(biāo)(redundant internal coordinate) （2) fopt是配合opt=z-matrix使用的，要求對(duì)所有變量進(jìn)行優(yōu)化。這個(gè)選項(xiàng)現(xiàn)在已經(jīng)很少人用了，通常直接使用opt即可。 （3）iop(5/13=1,1/11=1)。iop(5/13)=1要求哪怕SCF不收斂都繼續(xù)計(jì)算，該選項(xiàng)是用來調(diào)試用的，在實(shí)際應(yīng)用中不應(yīng)該出現(xiàn)。iop(1/11=1）即noeigentest，建議在結(jié)構(gòu)已經(jīng)很接近過渡態(tài)時(shí)使用，否則容易得到其他意想不到的虛頻，比如甲基旋轉(zhuǎn)。一般的建議是，能使用關(guān)鍵詞盡量避免使用IOP。首先IOP在多步計(jì)算中（比如opt freq）只能適用于第一步，而使用關(guān)鍵詞對(duì)所有步驟都適用。此外，在不同版本的高斯程序中，IOP參數(shù)可能會(huì)發(fā)生改變。 （4）optcyc=N, 即opt(maxcyc=N)，還有scf(maxcyc=300)。如果結(jié)構(gòu)或者SCF不收斂，增大默認(rèn)的周期數(shù)通常不會(huì)有改善，反而耗費(fèi)更多的計(jì)算時(shí)間。 （5) 如果optcyc寫成opt(maxcyc=N)，同時(shí)又使用opt=(ts,z-matrix)，同一個(gè)opt出現(xiàn)兩次，這種情況應(yīng)該避免，因?yàn)槌绦蛟谏煞菢?biāo)準(zhǔn)輸入（即輸出文件開始部分生成的一大堆IOP選項(xiàng)）時(shí)會(huì)對(duì)相同選項(xiàng)進(jìn)行加和，可能導(dǎo)致意想不到的問題。 （6）總的來說，初學(xué)高斯，建議從最少的選項(xiàng)開始，完成一個(gè)基本計(jì)算，然后添加適當(dāng)?shù)倪x項(xiàng)以實(shí)現(xiàn)額外的功能。直接從其他人那里拷貝過來輸入文件，可能適用于特定體系，但不一定在任何情況都適用。尤其是比如IOP（5/13=1），在正式計(jì)算中絕對(duì)應(yīng)該避免出現(xiàn) |
5樓2014-10-23 08:57:32
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +13 | 田洪有 2026-03-26 | 13/650 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 300求調(diào)劑，材料科學(xué)英一數(shù)二 +15 | leaflight 2026-03-24 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +6 | Lyy930824@ 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境工程 085701，267求調(diào)劑 +6 | minht 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
[考研] 277跪求調(diào)劑 +6 | 1915668 2026-03-27 | 10/500 |
|
|
|
[碩博家園] 招收生物學(xué)/細(xì)胞生物學(xué)調(diào)劑 +4 | IceGuo 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +7 | 爭取九點(diǎn)睡 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿華北電力大學(xué)能動(dòng)專碩，293，求調(diào)劑 +3 | 15537177284 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +6 | 曼殊2266 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 315分求調(diào)劑 +7 | 26考研上岸版26 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +11 | 陽陽哇塞 2026-03-27 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +7 | 墨墨漠 2026-03-25 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | question挽風(fēng) 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)338求調(diào)劑！ +6 | Zuhui0306 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 081200-11408-276學(xué)碩求調(diào)劑 +4 | 崔wj 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 341求調(diào)劑 +7 | 青檸檬1 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境專碩324分求調(diào)劑推薦 +5 | 軒小寧—— 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[有機(jī)交流]
 有機(jī)合成求助
 20+3
|
FENGSHUJEI 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料專碩找調(diào)劑 +5 | 哈哈哈吼吼吼哈 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研]
 085404電子信息284分求調(diào)劑
+4
|
13659058978 2026-03-24 | 4/200 |
|