 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1216 | 回復(fù): 3 | ||||
| 當(dāng)前主題已經(jīng)存檔。 | ||||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | ||||
zhaohscas1976銀蟲 (小有名氣)
|
[交流]
【討論】關(guān)于多個castep job的關(guān)系及其在linux下的運(yùn)行問題。
|
|||
|
我遇到的問題主要是關(guān)于多個castep的job的在執(zhí)行過程中的關(guān)系問題，我按照自己的理解把我遇到的問題描述如下，我百思不得其解，請大家討論幫忙： 比如我要計算鍺的聲子散射譜，同時計算態(tài)密度，則發(fā)現(xiàn)用materials studio生成的輸入文件是如下的一大堆： ====================== 2008-04-29 22:59 275 Ge.trjaux 2008-04-29 22:59 677 Ge.param 2008-04-29 22:59 15,947 Ge.cell 2008-04-29 22:59 731 Ge.kptaux 2008-04-29 22:59 445 Ge_PhonDisp.param 2008-04-29 22:59 17,493 Ge_PhonDisp.cell 2008-04-29 22:59 367 Ge_PhonDisp.kptaux 2008-04-29 22:59 445 Ge_PhonDOS.param 2008-04-29 22:59 17,561 Ge_PhonDOS.cell 2008-04-29 22:59 3,795 Ge_PhonDOS.kptaux ======================= 經(jīng)過分析，發(fā)現(xiàn)，上面由三個job,他們的任務(wù)的basename分別是：Ge、Ge_PhonDisp 和Ge_PhonDOS。 首先，我上面的這些文件是通過materials studio 中的計算聲子的設(shè)置得到的，具體的計算設(shè)置見我附件中的抓圖。 經(jīng)過上面的設(shè)置，可以得到上面的那些輸入文件，這些輸入文件，如果在materials studio 中運(yùn)行的時候，我們也不用去考慮什么，但是，我就是，不明白，這些輸入文件，如果拿到linux下怎樣去具體的執(zhí)行他們，我的意思，還是說這些job之間在運(yùn)行的時候的關(guān)系。 我曾經(jīng)在上海超級計算中心的曙光4000A的機(jī)器上首先執(zhí)行Ge 這個job， 然后，再分別執(zhí)行Ge_PhonDisp 和Ge_PhonDOS這兩個job，都不能成功運(yùn)行，但是，在我的windows下的materials studio 圖形用戶界面里提交，就不會有任何問題。 總之，我的問題是：如果用materials studio 圖形用戶界面為castep生成輸入文件的話，如果一次性生成的輸入文件有多 個cell和param文件，這時候，怎么樣在上海超級計算中心或其他的linux或unix下用命令行的方式正確的提交這些job來執(zhí)行這樣的castep任務(wù)�。� 非常疑惑！ |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 Photochemistry |
» 猜你喜歡
086502化學(xué)工程342求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
材料求調(diào)劑一志愿哈工大324
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
328求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
340求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
求調(diào)劑推薦 材料 304
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
291求調(diào)劑
已經(jīng)有19人回復(fù)
-
331環(huán)境科學(xué)與工程求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
289求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
315分求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
mink
至尊木蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 15 (小學(xué)生)
- 金幣: 16356.9
- 散金: 245
- 紅花: 1
- 帖子: 2877
- 在線: 613.3小時
- 蟲號: 138630
- 注冊: 2005-12-18
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
關(guān)于properties運(yùn)算的問題
★ ★ ★ ★
zzgyb(金幣+4,VIP+0):謝謝你的參與，歡迎繼續(xù)關(guān)注計算模擬版！
zzgyb(金幣+4,VIP+0):謝謝你的參與，歡迎繼續(xù)關(guān)注計算模擬版！
|
三個job,他們的任務(wù)的basename分別是：Ge、Ge_PhonDisp 和Ge_PhonDOS 你寫一個腳本，在計算完Ge job后，將Ge.check文件cp成Ge_PhonDisp.check Ge_PhonDOS.check 然后運(yùn)行，就可以了。 .check文件是體系的電子波函數(shù)數(shù)據(jù)以及體系的其他關(guān)鍵數(shù)據(jù)記錄文件或者有人稱是檢查點文件，后續(xù)計算需要在這個基礎(chǔ)上進(jìn)行的。 圖形界面是因為有一個后臺程序在處理這個工作。 參閱： help\Remote CASTEP jobs\Running CASTEP in standalone mode If you wish to calculate properties, you should execute the script for the main run first: RunCASTEP.sh -np 4 seedname When that run is complete, you should make copies of the .check file that will be used in all subsequent properties runs: cp seedname.check seedname_BandStr.check cp seedname.check seedname_DOS.check cp seedname.check seedname_Optics.check When the appropriate copies have been made, execute RunCASTEP for each properties run: RunCASTEP.sh -np 2 seedname_DOS RunCASTEP.sh -np 2 seedname_BandStr RunCASTEP.sh -np 4 seedname_Optics These jobs can be run independently because they do not share input or output files. [ Last edited by mink on 2008-5-6 at 17:41 ] |
3樓2008-05-06 17:33:28
truemantwo
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 4178.2
- 散金: 56
- 紅花: 3
- 帖子: 371
- 在線: 314.5小時
- 蟲號: 240829
- 注冊: 2006-04-09
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性I:結(jié)構(gòu)、力學(xué)和
2樓2008-05-05 17:34:48
zhaohscas1976
銀蟲 (小有名氣)
- 1ST強(qiáng)帖: 1
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 792.9
- 散金: 6
- 紅花: 4
- 帖子: 135
- 在線: 54.7小時
- 蟲號: 553808
- 注冊: 2008-05-05
- 性別: GG
- 專業(yè): 半導(dǎo)體材料
4樓2008-05-11 12:27:33
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 求調(diào)劑推薦 材料 304 +15 | 荷包蛋hyj 2026-03-26 | 15/750 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 331環(huán)境科學(xué)與工程求調(diào)劑 +3 | 熠然好運(yùn)氣 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 085602 化工專碩 338分 求調(diào)劑 +10 | 路癡小琪 2026-03-27 | 10/500 |
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +4 | 零八# 2026-03-27 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 考研化學(xué)308分求調(diào)劑 +10 | 你好明天你好 2026-03-23 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 292求調(diào)劑 +4 | 求求了收下我吧?/a> 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +8 | 匹克i 2026-03-23 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 316求調(diào)劑 +5 | 江辭666 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 351求調(diào)劑 +4 | 麥克阿磊 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑求收留 +7 | 果然有我 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +13 | Faune 2026-03-21 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 總分322求生物學(xué)/生化與分子/生物信息學(xué)相關(guān)調(diào)劑 +5 | 星沉uu 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 總分293求調(diào)劑 +6 | 加一一九 2026-03-25 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 291 求調(diào)劑 +7 | 化工2026屆畢業(yè)?/a> 2026-03-21 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 085600 材料與化工 329分求調(diào)劑 +9 | Mr. Z 2026-03-25 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 上海電力大學(xué)材料防護(hù)與新材料重點實驗室招收調(diào)劑研究生（材料、化學(xué)、電化學(xué)，環(huán)境） +4 | 我愛學(xué)電池 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考博] 26申博自薦 +3 | whh869393 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +7 | 十三加油 2026-03-21 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 276求調(diào)劑 +3 | YNRYG 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 一志愿070300浙大化學(xué)358分，求調(diào)劑！
+4
|
酥酥魚.. 2026-03-21 | 4/200 |
|