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分子動(dòng)力學(xué)的缺點(diǎn) 已有1人參與
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| 文章一篇分子動(dòng)力學(xué)和實(shí)驗(yàn)結(jié)合的文章，審稿人糾結(jié)在為什么模擬溫度跟實(shí)驗(yàn)溫度不一致。想請(qǐng)大牛幫分析一下分子動(dòng)力學(xué)的缺點(diǎn)或者給幾篇文獻(xiàn)作為佐證。謝謝 |
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ChemiAndy
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| 我猜 abinitio 的建議大概是這樣的，在你所用的力場(chǎng)參數(shù)和模擬條件下，該體系的理論模擬熔沸點(diǎn)與實(shí)驗(yàn)熔沸點(diǎn)并不對(duì)應(yīng)，因此模擬溫度也不必嚴(yán)格與實(shí)驗(yàn)溫度對(duì)應(yīng)。這是一個(gè)很好的point。但是不足以說服審稿人，即你的溫差到底是否影響你的定性結(jié)論和定量結(jié)果。進(jìn)一步說，好，你說理論與實(shí)驗(yàn)熔沸點(diǎn)不一致，那么請(qǐng)你給出對(duì)應(yīng)實(shí)驗(yàn)溫度的最佳理論溫度來？你怎么辦？你需要去用模擬該體系的理論熔沸點(diǎn)，然后去找對(duì)應(yīng)點(diǎn)。盡管這才是最嚴(yán)格的方法，但是，我基本沒見過去這樣做的，為什么？因?yàn)樘щy了，模擬熔沸點(diǎn)即相變是分子模擬最有挑戰(zhàn)的難題之一。所以，大家都不啃聲，假裝理論熔沸點(diǎn)與實(shí)驗(yàn)熔沸點(diǎn)是基本對(duì)應(yīng)的。那按照這個(gè)邏輯，你模擬溫度就應(yīng)該與實(shí)驗(yàn)溫度基本接近。所以，要扯理論熔沸點(diǎn)與實(shí)驗(yàn)熔沸點(diǎn)的不一致，是把簡(jiǎn)單問題復(fù)雜化了。不建議去這么回應(yīng)。 |
7樓2014-10-30 08:31:59
abinitio
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
|
被問到這個(gè)問題是正常的，一般來說，模擬的體系是一個(gè)沒有界面，沒有缺陷的理想晶體，因此，會(huì)存在過熱現(xiàn)象。另外，勢(shì)函數(shù)也會(huì)影響模擬的熔點(diǎn)值。 可參考以下文獻(xiàn)： Zhang, S. L. et al. Phys. B Condens. Matter 406, 2637–2641 (2011). L. Han, Q. An, R. Fu, L. Zheng, S. Luo.Phys. B: Condens. Matter, 405 (2010), p. 748 P. Buffat, J. Borel.Phys. Rev. A, 13 (1976), p. 2287 A. Kuksin, et al. Comput. Phys. Commun., 177 (2007), p. 34 |
2樓2014-10-29 08:19:55
3樓2014-10-29 12:05:22
abinitio
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4樓2014-10-29 14:31:19
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