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求設(shè)計(jì)熒光定量PCR引物一對(duì)(SYBGREEN) 已有1人參與
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各位大神,最近需做熒光定量,求設(shè)計(jì)引物一對(duì),我會(huì)選取幾對(duì)引物進(jìn)行試驗(yàn),然后把結(jié)果反饋給大家。 上引物模板:ATGTATCACC CGCAGTGCGA GCTCCTGACG ATGGCGCACG AAACGCCGGA CCTGGACGCC 61 GGCCAGCCGC ACCTAACCGT CTCCGGCGTC GCCAGCATCC CGGCAGAGCT GAGCTTCCAC 121 CTGCTGCACT CGCTCGACGC CGCGGCGGCG GTCAATCCCG TCACGGCGCC GCCGCAGTCC 181 ACCATCGACT ACTTCCTCGG CGGCGCCGAT CCCCACCAGC AGGCCATGCA GTACGAGCCG 241 CTGCCGCCCG CCGCGGGCGG CCACCACCAG TACACCATGG ACATGTTCCG CGACTACTGC 301 GACGGCAACT ACCCCACCGC CGAGCCGTAC ATCCGCGGGA CAATGACTGG AGCCCTCGTG 361 TTCGGGGCCA CCGACGACGA CGACTCGGCC GCTGCCGCCT ACATGCCCGG GGGGCACTTT 421 GAGACCTCCC CGCCGCCGCC ACGCGCCACC GGCCGCGGCA GGAAGCGGGG CAGGGCGCTG 481 GGCGGCGGCT TCCATGCTGT GCTGGCCAAC GGCGTCGAGA AGAAGGAGAA GCAGCGCCGG 541 CTGCGGCTCA CCGAGAAGTT TACGGCCCTC ATGCACCTCA TACCCAACGT TACGAAG 下引物模板: ACT 601 GATAGGGCGA CGGTGATCTC GGACGCGATC GAGTACATCC AGGAGCTGGG GAGGACGGTG 661 GAGGAGCTGA CGCTGCTGGT GGAGAAGAAG CGGCGCCGGA GGGAGCTGCA GGGGGACGTC 721 GTGGACGCGG CGCCGGCTGC GGTGGTTGCT GCCGCCGGTG AGGCGGAGAG CTCGGAGGGC 781 GAGGTGGCTC CTCCGCCGCT GGCCGTGCCG CGGCAGCCGA TCCGGAGCAC GTACATCCAG 841 CGGCGGAGCA AGGACACGTC CGTGGACGTG CGGATCGTGG AGGAGGACGT GAACATCAAG 901 CTCACCAAGC GCCGGCGCGA CGGGTGCCTC GCAGCCGCGT CGCGCGCGCT GGACGACCTC 961 CGCCTTGACC TCGTCCACCT CTCCGGCGGC AAGATCGGTG ACTGTCAAAT CTACATGTTC 1021 AACACCAAGA TTCACAAGGG GTCTTCAGTG TTTGCGAGTG CAGTGGCCGG TAGGCTGATG 1081 GAAGTGGTGG ACGAGTACTA G |
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做熒光定量沒(méi)必要限定位置吧?看表達(dá)就行,給樓主設(shè)了幾對(duì)引物: (1)F:TTCAACACCAAGATTCACAAG (TM=60.8) R:GTCCACCACTTCCATCAG(TM=61.2) (2) F:ATGTTCAACACCAAGATTCAC(TM=60.9) R:GTCCACCACTTCCATCAG(TM=61.2) (3) F:GTCCACCACTTCCATCAG(YM=62.2) R:ACCACTTCCATCAGCCTAC(TM=63) 你先試試,不同的引物表達(dá)量可能有一點(diǎn)點(diǎn)差異,但是總體是不影響與對(duì)照之間的表達(dá)差異的。 |
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