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sunny_pl0911銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
有關差異蛋白組的問題，求大神幫助！！！ 已有3人參與
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小女子新蟲一枚，從沒接觸過蛋白組相關的知識，最近想在原來的實驗基礎上進行差異蛋白組的試驗，求大神給一條明路 。我以前的試驗是關于黃瓜的逆境生理，我的問題是：1、有關差異蛋白組的試驗從哪里開展？是否用iTRAQ就可以得到相關的差異蛋白的信息？ 2、找到差異蛋白之后如何進行更深入的研究？ 3、能否推薦幾篇國際上最新的有關作物逆境差異蛋白組研究的文章？ 不勝感激，小女子在這里叩謝了！ |
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sunny_pl0911
銅蟲 (初入文壇)
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- 專業(yè): 植物生理與生化
送紅花一朵 
3樓2015-06-24 09:22:23
| 你好，iTRAQ是做差異蛋白的經(jīng)典方法。這一步是發(fā)現(xiàn)差異蛋白，然后做個驗證，用與iTRAQ正交的方法，比如werstern，MRM, 或者PCR都行，證明確實是表達有差異，然后再做功能學的實驗。沒做過植物的研究，這個就不好多說了。給個郵箱，我發(fā)你一篇個人覺得還算經(jīng)典的逆境蛋白組學的綜述。 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
2樓2014-12-01 14:35:48
4樓2015-06-24 13:30:03
calorimetry
銅蟲 (正式寫手)
- 應助: 51 (初中生)
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- 專業(yè): 生物大分子結構與功能
【答案】應助回帖
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1、有關差異蛋白組的試驗從哪里開展？是否用iTRAQ就可以得到相關的差異蛋白的信息？ iTRAQ（isobaric tags for relative and absolute quantitation）技術是由AB SCIEX公司研發(fā)的一種體外同重同位素標記的相對與絕對定量技術。該技術利用多種同位素試劑標記蛋白多肽N末端或賴氨酸側鏈基團，經(jīng)高精度質譜儀串聯(lián)分析，可同時比較多達8種樣品之間的蛋白表達量，是近年來定量蛋白質組學常用的高通量篩選技術。這不過是差異蛋白質組的一種研究方法。其他的研究方法很多，比如二維電泳，werstern blotting，基因表達譜等方法多了去了。 2、找到差異蛋白之后如何進行更深入的研究？ 空間結構的預測與測定、功能的預測與測定、相互作用的預測與測定、折疊與蛋白質穩(wěn)定性、生物大分子網(wǎng)絡（基因表達網(wǎng)絡、信號傳導網(wǎng)絡、代謝網(wǎng)絡等），你想具體怎么討論，我們可以再具體討論。 3、能否推薦幾篇國際上最新的有關作物逆境差異蛋白組研究的文章？ 這在SCI文獻庫里很容易用關鍵詞搜出來呀。到是植物蛋白質組學研究的手冊，你不好找，植物蛋白質組學研究的手冊要嗎？英文版的PDF，要的話，我送你一本，發(fā)在論壇里。 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
5樓2015-06-24 15:44:25
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