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sunny_pl0911銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
有關(guān)差異蛋白組的問題，求大神幫助�。�！ 已有3人參與
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小女子新蟲一枚，從沒接觸過蛋白組相關(guān)的知識(shí)，最近想在原來的實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)上進(jìn)行差異蛋白組的試驗(yàn)，求大神給一條明路 。我以前的試驗(yàn)是關(guān)于黃瓜的逆境生理，我的問題是：1、有關(guān)差異蛋白組的試驗(yàn)從哪里開展？是否用iTRAQ就可以得到相關(guān)的差異蛋白的信息？ 2、找到差異蛋白之后如何進(jìn)行更深入的研究？ 3、能否推薦幾篇國(guó)際上最新的有關(guān)作物逆境差異蛋白組研究的文章？ 不勝感激，小女子在這里叩謝了！ |
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4樓2015-06-24 13:30:03
| 你好，iTRAQ是做差異蛋白的經(jīng)典方法。這一步是發(fā)現(xiàn)差異蛋白，然后做個(gè)驗(yàn)證，用與iTRAQ正交的方法，比如werstern，MRM, 或者PCR都行，證明確實(shí)是表達(dá)有差異，然后再做功能學(xué)的實(shí)驗(yàn)。沒做過植物的研究，這個(gè)就不好多說了。給個(gè)郵箱，我發(fā)你一篇個(gè)人覺得還算經(jīng)典的逆境蛋白組學(xué)的綜述。 |
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sunny_pl09112樓2014-12-01 14:35:48
sunny_pl0911
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3樓2015-06-24 09:22:23
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- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
【答案】應(yīng)助回帖
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1、有關(guān)差異蛋白組的試驗(yàn)從哪里開展？是否用iTRAQ就可以得到相關(guān)的差異蛋白的信息？ iTRAQ（isobaric tags for relative and absolute quantitation）技術(shù)是由AB SCIEX公司研發(fā)的一種體外同重同位素標(biāo)記的相對(duì)與絕對(duì)定量技術(shù)。該技術(shù)利用多種同位素試劑標(biāo)記蛋白多肽N末端或賴氨酸側(cè)鏈基團(tuán)，經(jīng)高精度質(zhì)譜儀串聯(lián)分析，可同時(shí)比較多達(dá)8種樣品之間的蛋白表達(dá)量，是近年來定量蛋白質(zhì)組學(xué)常用的高通量篩選技術(shù)。這不過是差異蛋白質(zhì)組的一種研究方法。其他的研究方法很多，比如二維電泳，werstern blotting，基因表達(dá)譜等方法多了去了。 2、找到差異蛋白之后如何進(jìn)行更深入的研究？ 空間結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)與測(cè)定、功能的預(yù)測(cè)與測(cè)定、相互作用的預(yù)測(cè)與測(cè)定、折疊與蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、生物大分子網(wǎng)絡(luò)（基因表達(dá)網(wǎng)絡(luò)、信號(hào)傳導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)、代謝網(wǎng)絡(luò)等），你想具體怎么討論，我們可以再具體討論。 3、能否推薦幾篇國(guó)際上最新的有關(guān)作物逆境差異蛋白組研究的文章？ 這在SCI文獻(xiàn)庫里很容易用關(guān)鍵詞搜出來呀。到是植物蛋白質(zhì)組學(xué)研究的手冊(cè)，你不好找，植物蛋白質(zhì)組學(xué)研究的手冊(cè)要嗎？英文版的PDF，要的話，我送你一本，發(fā)在論壇里。 |
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5樓2015-06-24 15:44:25
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