 |
 |
 |
| 24小時(shí)熱門(mén)版塊排行榜 |
- >論壇更新日志 (2450)
- >考研 (182)
- >導(dǎo)師招生 (174)
- >蟲(chóng)友互識(shí) (52)
- >論文投稿 (51)
- >博后之家 (37)
- >基金申請(qǐng) (34)
- >考博 (31)
- >教師之家 (26)
- >公派出國(guó) (25)
- >碩博家園 (16)
- >文獻(xiàn)求助 (16)
- >找工作 (12)
- >論文道賀祈福 (11)
- >招聘信息布告欄 (7)
- >外文書(shū)籍求助 (6)
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1276 | 回復(fù): 1 | ||||
zhangmao511鐵蟲(chóng) (小有名氣)
|
[求助]
Gromacs模擬中位置限制性模擬的問(wèn)題��！
|
|
有個(gè)問(wèn)題想向大家請(qǐng)教一下，關(guān)于Gromacs的位置限制性模擬，我在網(wǎng)上看到有2種protocl. Protocl A 是在能量最小化后，先進(jìn)行位置限制性模擬（也就是將蛋白的所有重原子以1000 kJ/(mol nm2)限制住，打開(kāi)溫度耦合進(jìn)行100皮秒的模擬），再進(jìn)行非限制性的NVT，接著進(jìn)行非限制性的NPT，最后進(jìn)行production MD. Protocl B是在能量最小化后，進(jìn)行限制性的NVT 100皮秒，再進(jìn)行限制性的NPT 100皮秒，最后進(jìn)行production MD. 這2種Protocl，有沒(méi)有實(shí)質(zhì)性的區(qū)別呢？還是說(shuō)其實(shí)是一樣的效果？ 分別用這2種Protocl會(huì)會(huì)使最后的production MD產(chǎn)生不同的結(jié)果嗎？十分感謝！  |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專(zhuān)輯推薦
 gromacs | xuexijisuan |
» 猜你喜歡
276求調(diào)劑。有半年電池和半年高分子實(shí)習(xí)經(jīng)歷
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
一志愿南航材料專(zhuān)317分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
生物學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
284求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
一志愿山東大學(xué)藥學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
07化學(xué)280分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
298-一志愿中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)-求調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
求材料，環(huán)境專(zhuān)業(yè)調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
335求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 膜蛋白Gromacs模擬的問(wèn)題
已經(jīng)有5人回復(fù)
- gromacs安裝出錯(cuò)求助
已經(jīng)有4人回復(fù)
- gromacs NEMD模擬
已經(jīng)有12人回復(fù)
- gromacs 模擬NPT系宗出問(wèn)題
已經(jīng)有8人回復(fù)
- gromacs NPT 系綜如何模擬？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- gromacs模擬分子在二氧化硅表面的吸附
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 如何使用gromacs進(jìn)行多分子模擬？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 求Gromacs中文手冊(cè)
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 新手學(xué)習(xí)Gromacs 大概需要多少時(shí)間
已經(jīng)有8人回復(fù)
- gromacs運(yùn)行出錯(cuò)，求方案，謝謝�。�！
已經(jīng)有6人回復(fù)
- gromacs模擬離子液體，建立gro文件
已經(jīng)有5人回復(fù)
- gromacs做全原子模擬時(shí)候，突然到MD這一步出錯(cuò)
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】請(qǐng)教如何使用GROMACS做PMF？
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】gromacs的又一個(gè)問(wèn)題
已經(jīng)有22人回復(fù)
- 【求助】求助詳細(xì)安裝gromacs的步驟，謝謝
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【求助】求GROMACS模擬表面活性劑在油水表面的行為的例子
已經(jīng)有7人回復(fù)
zhangmao511
鐵蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 33
- 紅花: 2
- 帖子: 136
- 在線(xiàn): 29.7小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 2553312
- 注冊(cè): 2013-07-19
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 蛋白質(zhì)組學(xué)
2樓2014-12-03 20:43:11
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 zhangmao511 的主題更新
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿北京化工大學(xué) 070300 學(xué)碩 336分 求調(diào)劑 +7 | vv迷 2026-03-22 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 306求0703調(diào)劑一志愿華中師范 +7 | 紙魚(yú)ly 2026-03-21 | 8/400 |
|
|
[考研] 材料292調(diào)劑 +4 | 橘頌思美人 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿國(guó)科過(guò)程所081700，274求調(diào)劑 +3 | 三水研0水立方 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 269求調(diào)劑 +4 | 我想讀研11 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 接收2026碩士調(diào)劑(學(xué)碩+專(zhuān)碩) +4 | allen-yin 2026-03-23 | 6/300 |
|
|
|
[考研]
 一志愿070300浙大化學(xué)358分，求調(diào)劑！
+4
|
酥酥魚(yú).. 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 306求調(diào)劑 +5 | 來(lái)好運(yùn)來(lái)來(lái)來(lái) 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +7 | 懷瑾握瑜l 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 260求調(diào)劑 +3 | 朱芷琳 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué)調(diào)劑 +5 | Surekei 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 資源與環(huán)境 調(diào)劑申請(qǐng)(333分) +5 | holy J 2026-03-21 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿深大，0703化學(xué)，總分302，求調(diào)劑 +4 | 七月-七七 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 301求調(diào)劑 +10 | yy要上岸呀 2026-03-17 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +4 | ydfyh 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿武漢理工材料工程專(zhuān)碩調(diào)劑 +9 | Doleres 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 0856調(diào)劑，是學(xué)校就去 +8 | sllhht 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[論文投稿]
申請(qǐng)回稿延期一個(gè)月，編輯同意了。但系統(tǒng)上的時(shí)間沒(méi)變，給編輯又寫(xiě)郵件了，沒(méi)回復(fù)
 10+3
|
wangf9518 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué)調(diào)劑招人�。。� +3 | 山海天嵐 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 收復(fù)試調(diào)劑生 +4 | 雨后秋荷 2026-03-18 | 4/200 |
|