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zhuxinzhe

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[交流] gromacs 中rdf問(wèn)題

我的盒子里有12個(gè)相同的分子和其他的小分子，我想算這12個(gè)分子間的幾何中心距離（center of geometry,COG）的RDF，但得出的曲線為什么不是連續(xù)的呢？我輸入的命令是g_rdf -f .trr -s .tpr -n.ndx -rdf res_cog -o .xvg，我不知道-rdf res_cog是不是表示幾何中心，求大神指教啊

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1樓 2014-12-05 14:30:21

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zhuxinzhe: 金幣+10 2014-12-05 20:42:03

直接查看g_rdf -help就知道了

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只做不說(shuō)，明知沒(méi)地位，堅(jiān)信有機(jī)會(huì)

2樓2014-12-05 15:30:19

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