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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » 生物信息 » psi-blast使用求助
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[求助]
psi-blast使用求助
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| 您好，最近使用psi-blast時本地輸入以下命令psiblast -query seq.fasta -db db -num_threads 15 -out outfile.txt -outfmt 6后得到一些結果，但是增加迭代次數(shù)參數(shù)-num_interations 2后出現(xiàn)警告并說Frequency ratios for PSSM are all zeros, frequency ratios for BLOSUM62 will be used during traceback in composition based statistics.為什么pssm會全部為0？是否需要加載pssm文件，如果是的話這個文件時從哪里產生的？為什么默認參數(shù)時沒有這個報錯?剛開始使用，不太懂，求大神指教！跪謝！ |
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