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鑒定細(xì)菌，提取DNA，PCR擴(kuò)增16s rRNA并測(cè)序得到序列，要NCBI blast 搜索，不知道用BLAST Assembled Genomes，還是Basic BLAST？如果選前者，請(qǐng)具體說(shuō)明一下怎么操作。如果用后者的nucleotide blast，Choose Search Set中的Database應(yīng)該選哪一個(gè)呀？謝謝了。

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1樓 2010-06-12 16:57:37

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mazhenning

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scelab(金幣+2):你最好弄幾張圖上來(lái)，呵呵 2010-06-12 22:56:15
zouting(金幣+1):是搜索序列相似性最高的，謝謝 2010-06-14 08:58:55

是二者比對(duì)，還是從數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索與你的序列相似性最高的？
如果是后者，到NCBI的blast頁(yè)面，選擇nucleotide blast，數(shù)據(jù)庫(kù)選others，也就是（nr/nt）.
不知道我有沒(méi)有理解你的意思，呵呵。

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2樓2010-06-12 22:25:58

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dhmdddd

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zouting(金幣+1): 2010-06-14 08:56:54
lstt09nk(金幣+1):很熱心~~ 2010-06-14 21:56:17

論壇里好象有怎么用NCBI的中文版，你搜下了，如果不行的話你的郵箱？給你發(fā)過(guò)去�。�

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上班族，學(xué)習(xí)ing……

3樓2010-06-13 10:12:35

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Originally posted by mazhenning at 2010-06-12 22:25:58:
是二者比對(duì)，還是從數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索與你的序列相似性最高的？
如果是后者，到NCBI的blast頁(yè)面，選擇nucleotide blast，數(shù)據(jù)庫(kù)選others，也就是（nr/nt）.
不知道我有沒(méi)有理解你的意思，呵呵。

比對(duì)過(guò)了，看來(lái)是我提的不純或者是引物特異性還不夠，比對(duì)出來(lái)好多都是99%的

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4樓2010-06-14 09:06:28

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Originally posted by dhmdddd at 2010-06-13 10:12:35:
論壇里好象有怎么用NCBI的中文版，你搜下了，如果不行的話你的郵箱？給你發(fā)過(guò)去！！

恩，我有一個(gè)PDF 介紹的，但是不是很清楚。麻煩你發(fā)一個(gè)給我吧，zouting0723@163.com
謝謝了

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5樓2010-06-14 09:08:22

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還想請(qǐng)教一下，PCR產(chǎn)物直接鑒定是不是效果比較差呀

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6樓2010-06-17 11:21:31

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rabbit9355

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能不能給我也發(fā)一個(gè)？cherrychj@163.com

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7樓2010-06-25 19:54:39

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Originally posted by rabbit9355 at 2010-06-25 19:54:39:

能不能給我也發(fā)一個(gè)？cherrychj@163.com

嘿嘿，搭車同申請(qǐng)，給我也發(fā)一個(gè)吧，謝謝
dxlxp@163.com

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難免埋怨時(shí)間的手，把相愛(ài)寫(xiě)成相愛(ài)過(guò)

8樓2010-06-25 21:36:09

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jiyawei

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小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖

能不能也給我發(fā)一下呀applejiyawei@sina.com 謝謝

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堅(jiān)持就是勝利！

9樓2014-02-22 00:26:06

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