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fengjunchen銅蟲(chóng) (小有名氣)
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[交流]
想學(xué)習(xí)Amber進(jìn)行動(dòng)力學(xué)模擬，怎么入門？ 已有9人參與
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本來(lái)應(yīng)該是求助帖……不混論壇沒(méi)金幣發(fā)布出來(lái)。 本人剛剛?cè)雽W(xué)，做實(shí)驗(yàn)的基本不太會(huì)信息學(xué)的東西，導(dǎo)師給的方向需要?jiǎng)恿W(xué)模擬，關(guān)注酶活和蛋白的熱穩(wěn)定性。 詢問(wèn)學(xué)院里信息學(xué)的老師，向我推薦了Amber。稍微搜了搜感覺(jué)各種看不明白，主要有一下幾個(gè)問(wèn)題： 1、Amber主頁(yè)上有兩個(gè)軟件，Amber14和AmberTools14，前者收費(fèi)，后者可以直接下載；那么，可以只使用后者計(jì)算嗎？Amber14是否必須，因?yàn)槲抑赖故墙^對(duì)不會(huì)出錢買的……Amber14能否或者怎樣申請(qǐng)免費(fèi)？ 2、個(gè)人之前沒(méi)用過(guò)linux，Amber是否能在Windows下運(yùn)行？否則熟悉linux又是個(gè)挺麻煩的事兒。當(dāng)然，從下載的bz2的文件看來(lái)好像windows可能性不大唉…… 3、看了一些網(wǎng)上的帖子，好像還需要安很多東西，還有設(shè)置什么變量……還看到了各種裝不上的求助帖。是否真那么費(fèi)勁？ 4、最后嘛，就是厚顏無(wú)恥求教程了~~一定要0基礎(chǔ)的啊，不然肯定看不懂。 求各位前輩能給些幫助~~ |
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