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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 生物醫(yī)藥區(qū) » 分子生物 » 綜合其他 » 求核酸染料有哪些？
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keven7928至尊木蟲 (知名作家)
水手
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[求助]
求核酸染料有哪些？ 已有4人參與
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| 最近在做基因傳遞的試驗，用激光共聚焦觀察材料和基因的胞內(nèi)軌跡，想用YOYO1標記DNA,RhB標記材料，但是YOYO1太貴了，買不起，還有其他可以用的染料嗎？ |
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【答案】應助回帖
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myprayer: 金幣+1, 贈人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2015-01-09 19:35:16
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電泳后，核酸需經(jīng)染色才能顯色出帶型，常用以下核酸染色劑： 1、溴化乙錠（ethidium bromide, EB） 最常用的核酸熒光染料，可嵌入核酸雙鏈的配對堿基之間，在紫外線激發(fā)下，發(fā)出桔紅色熒光。 EB-DNA復合物中的EB發(fā)出的熒光，比游離的凝膠中的EB發(fā)出的熒光強度大10倍，因此無需洗凈背景即可清楚觀察核酸帶型。若EB背景太深，可將凝膠 浸泡于1mmol/LMgSO4中1h或10mmol/L MgCl2中5min，使非結合的EB褪色，這 樣可檢查到10ng的DNA樣品，EB也可用于檢測單鏈DNA或RNA，但其對單鏈核酸的親和力相對較小，熒光產(chǎn)率也相對較低。 在凝膠或電泳緩沖液中加入終濃度為0.5μg/ml的EB，染色可在電泳過程中進行，能隨時觀察核酸的遷移情況。但EB帶正電荷，嵌入堿基后增加了 核酸分子的剛性，使遷移率減慢，故不宜用于測定核酸分子量的大小，這時應在電泳后將凝膠浸入0.5μg/ml的EB水溶液中10min進行染色。EB見光 易分解，應于4℃避光保存， 2、吖啶橙（acridine orange, AO）： 吖啶橙可嵌入雙鏈核酸堿基對之間，在254nm紫外線激發(fā)下發(fā)出530nm的綠色熒光；還通過靜電與單鏈核酸的磷酸基結合，在254nm紫外線激發(fā) 下產(chǎn)生640nm的紅色熒光。因此可區(qū)分單鏈和雙鏈核酸，靈敏度分別為0.1μg和0.05μg。但吖啶橙的染色操作要求嚴格，應在 22℃，0.01mol/L磷酸鈉緩沖液（pH7.0）中避光浸泡30min，然后在搪瓷盤中用該緩沖劑4℃脫色過夜或22℃脫色1~2小時。 3、銀（Ag+）試劑： Ag+與核酸形成穩(wěn)定復合物，然后用甲醛使Ag+還原成銀顆粒。AgNO3等試劑可使聚丙烯酰胺凝膠上的單鏈，雙鏈DNA及 RNA都染成黑褐色。銀染法的靈敏度比EB染色高200倍左右，比亞甲藍染色高100~1000倍，在小于0.5mm厚的凝膠中，能檢測出0.5ng的 RNA，其缺點是專一性不強，能與蛋白質，去污劑反應也產(chǎn)生褐色，而且對DNA的染色定量不準確。銀與DNA穩(wěn)定結合，對DNA有破壞作用，不適于DNA 片段回收的制備。 4、亞甲藍（methylene blue） 可將RNA染成藍色，但靈敏度不高，而且操作時間長。染色過程：膠浸泡于0.02%的亞甲藍，10mmol/L Tris-Ac（pH8.3），4℃放置1~2h，用凈水洗5~8h（反復換水），帶型肉眼可見，最低檢測量為 250ng。 |
2樓2015-01-08 22:29:46
keven7928
至尊木蟲 (知名作家)
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4樓2015-01-09 14:54:25
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6樓2015-02-26 08:53:00
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