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清風(fēng)凌云007金蟲 (小有名氣)
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[求助]
用G09優(yōu)化激發(fā)態(tài)及熒光光譜計(jì)算 已有1人參與
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我要算一個(gè)體系的熒光光譜，看了好多小木蟲的帖子越看越糊涂了，還看了G09的英文說(shuō)明，在SCRF這有說(shuō)明（http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_scrf.htm），我只算氣態(tài)的，總結(jié)了下是不是需要step1、2、4、5、6？step7是否需要計(jì)算？希望計(jì)算高手們、前輩們給指點(diǎn)迷津，我這樣算到底對(duì)不對(duì)，如果不對(duì)應(yīng)該怎么算呢，現(xiàn)在真是非常著急，都不想放假了，先在此謝過(guò)各位大神�。∥业挠�(jì)算步驟如下(現(xiàn)在在進(jìn)行第三步)， 1、# opt freq b3lyp/6-31g(d) 基態(tài)分子結(jié)構(gòu)優(yōu)化及頻率計(jì)算 2、# td(nstates=20) b3lyp/6-31g(d) 吸收光譜計(jì)算 3、# opt td(nstates=20,root=1,direct) b3lyp/6-31g(d) 單重態(tài)第一激發(fā)態(tài)優(yōu)化（優(yōu)化基礎(chǔ)應(yīng)該用優(yōu)化基態(tài)結(jié)果還是吸收光譜計(jì)算結(jié)果？？？？？） 4、# freq td(nstates=20,root=1,direct) b3lyp/6-31g(d) 單重態(tài)第一激發(fā)態(tài)優(yōu)化結(jié)構(gòu)頻率計(jì)算 5、# td(nstates=20) b3lyp/6-31g(d) 單重態(tài)第一激發(fā)態(tài)發(fā)射 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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清風(fēng)凌云007: 金幣+50, ★★★很有幫助, 希望大神繼續(xù)指導(dǎo)我的回帖，多謝呀 2015-01-24 14:00:50
清風(fēng)凌云007: 金幣+50, ★★★很有幫助, 希望大神繼續(xù)指導(dǎo)我的回帖，多謝呀 2015-01-24 14:00:50
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手冊(cè)上的例子還有我們?cè)谡搲镉懻摰亩际窃谌軇┲械模枰紤]溶劑的平衡化和非平衡化的作用， 還有在TDDFT和DFT過(guò)程中，溶劑的作用。所以需要1-7，確切的說(shuō)是1.3.4.5.6.7這幾部。 如果說(shuō)，你只計(jì)算在空氣中的發(fā)射譜，那么這個(gè)很簡(jiǎn)單，下面的步驟 1：# opt freq b3lyp/6-31g(d) 基態(tài)分子結(jié)構(gòu)優(yōu)化及頻率計(jì)算 2：# opt td(nstates=20,root=1,direct) b3lyp/6-31g(d) 單重態(tài)第一激發(fā)態(tài)優(yōu)化（優(yōu)化基礎(chǔ)應(yīng)該用優(yōu)化基態(tài)結(jié)果還是吸收光譜計(jì)算結(jié)果？？？？？ ps：針對(duì)你的問(wèn)題，是這樣的，這是激發(fā)態(tài)的優(yōu)化，如果說(shuō)計(jì)算發(fā)射，我們要看從s1-s0的發(fā)射，基于s0 優(yōu)化的結(jié)構(gòu)優(yōu)化s1 在進(jìn)行完上述步驟之后，在優(yōu)化s1的輸出文件中，會(huì)有如下的數(shù)據(jù)： Excitation energies and oscillator strengths: Excited State 1: Singlet-A 1.7417 eV 711.84 nm f=0.0001 <S**2>=0.000 167 ->168 -0.70045 This state for optimization and/or second-order correction. Total Energy, E(TD-HF/TD-KS) = -2006.02553586 Copying the excited state density for this state as the 1-particle RhoCI density. Excited State 2: Singlet-A 2.5732 eV 481.82 nm f=0.1422 <S**2>=0.000 167 ->169 -0.69630 Excited State 3: Singlet-A 2.5993 eV 476.99 nm f=0.0028 <S**2>=0.000 165 ->168 0.44525 166 ->168 0.52944 默認(rèn)的是3個(gè)，因?yàn)槟J(rèn)的nstates=3.看第一個(gè)td的波長(zhǎng)就是發(fā)射的熒光的波長(zhǎng) ps：很多人，還在優(yōu)化了s1的結(jié)構(gòu)后，又做了一個(gè)td，其實(shí)沒有必要，當(dāng)然你以可以進(jìn)行，計(jì)算出來(lái)的結(jié)果，和我們優(yōu)化s1出來(lái)的結(jié)構(gòu)的第一td是一樣的。 綜上所述，計(jì)算空氣中的熒光，只需要2步，優(yōu)化s0，基于s0優(yōu)化s1，然后從s1輸出文件找第一個(gè)td波長(zhǎng)。 over |
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6樓2015-01-24 10:53:34
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按照我們這個(gè)計(jì)算方式，計(jì)算的只是一個(gè)波長(zhǎng)， 如果說(shuō)非要做出譜線，那么就采用下面的步驟： 1：那你計(jì)算td的文件的輸出文件.log或者是.out，放到高斯view中， 點(diǎn)擊results，然后選擇UV-VIS,會(huì)看到一個(gè)圖像，如下圖一，但是這個(gè)圖像時(shí)我們計(jì)算td時(shí)候全部的，我們要看的是第一個(gè)td對(duì)應(yīng)的發(fā)射。所以這個(gè)圖像不是。 2：在圖像的中，在x軸上，找到我們輸出文件第一個(gè)td對(duì)應(yīng)的波長(zhǎng)，假如說(shuō)是350nm。就在350nm處，右鍵。--save data-（可以設(shè)置開始，結(jié)束，還有間隔范圍）---保存數(shù)據(jù)后，使用origin作圖。如圖二 3：圖3才是我們的熒光光譜。 3.png 1.png 2.jpg |
12樓2015-01-24 16:00:26
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2樓2015-01-23 19:33:53
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3樓2015-01-23 19:56:52
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4樓2015-01-24 05:32:20
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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仔細(xì)看一看我的這個(gè)帖子。 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7928054 還有相關(guān)的鏈接。 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=5546124&fpage=1&target=self&page=1 |
5樓2015-01-24 10:36:34
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送紅花一朵 |
多謝大神指教，我看了兩個(gè)帖子，還是有一點(diǎn)不明白，就是怎么做發(fā)射光譜圖呢，要是作圖是要在優(yōu)化激發(fā)態(tài)基礎(chǔ)上做TD 嗎？也就是我的最后一步 5、# td(nstates=20) b3lyp/6-31g(d) 單重態(tài)第一激發(fā)態(tài)發(fā)射 還有就是畫圖要用chk文件嗎？只有out或log文件應(yīng)該怎么畫圖呢？在我的輸入文件（如下）中輸入%chk=2.gif.chk就是生成了chk文件吧，但是我打不開，看了好多論壇上的帖子有的說(shuō)要轉(zhuǎn)化成fchk，但是我按照說(shuō)的轉(zhuǎn)化不了 %chk=2.chk %mem=100MW %nproc=1 # opt b3lyp/6-31+g |
7樓2015-01-24 13:49:13
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8樓2015-01-24 13:50:01
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