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zaasyangyong

金蟲 (正式寫手)

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專業(yè): 植物病理學(xué)

[求助] 擬南芥T-DNA插入突變體的T-DNA序列方向問題

求教大家一個T-DNA插入擬南芥突變體的問題：
買到擬南芥的T-DNA插入突變體，在TAIR上查到插入的載體為pAC161，進入這個載體序列的鏈接 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AJ537514?report=GenBank)，給出的信息是：載體序列長10828bp，T-DNA right border為3287..3311，T-DNA left border為 8341..8364。那么我以為3311-8364這段序列不是應(yīng)該為T-DNA的插入序列嗎？也就是說不是應(yīng)該T-DNA的left border 的8364向右方向連接擬南芥序列嗎？
但是TAIR上所顯示的這個擬南芥突變體的序列信息（T-DNA部分序列連接擬南芥基因的部分序列，PCR獲得的）是：T-DNA的left border 的8341向左方向連接擬南芥序列。那么這樣的話，T-DNA序列應(yīng)該是 pAC161中right border 3287bp向前和left border 8346bp向后的序列了？到底是怎么回事呢？
這個pAC161載體的T-DNA序列都包括哪些單元呢？請使用過的牛人明示，謝謝！

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算了

1樓 2015-03-30 17:57:10

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

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