版塊導(dǎo)航: 正在加載中...

應(yīng)《網(wǎng)絡(luò)安全法》要求，自2017年10月1日起，未進(jìn)行實(shí)名認(rèn)證將不得使用互聯(lián)網(wǎng)跟帖服務(wù)。為保障您的帳號(hào)能夠正常使用，請(qǐng)盡快對(duì)帳號(hào)進(jìn)行手機(jī)號(hào)驗(yàn)證，感謝您的理解與支持！

24小時(shí)熱門版塊排行榜

北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

返回列表

當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖

tbw258

銅蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 3 (幼兒園)
金幣: 183.5
散金: 10
帖子: 44
在線: 36.3小時(shí)
蟲號(hào): 2537455
注冊(cè): 2013-07-08
性別: GG
專業(yè): 藥物設(shè)計(jì)與藥物信息

[求助] gromacs 怎么生成or怎么獲取含有非標(biāo)準(zhǔn)原子硼的小分子力場(chǎng)文件（例如苯硼酸）已有1人參與

如題，我?guī)缀鯂L試了所有的工具入 ATB PRODRG charmmaswiss ambertools acpype 都沒(méi)有成功，郁悶極了

回復(fù)此樓

» 猜你喜歡

332求調(diào)劑已經(jīng)有5人回復(fù)
085701求調(diào)劑初試286分已經(jīng)有3人回復(fù)
材料工程294求調(diào)劑已經(jīng)有4人回復(fù)
本科新能源科學(xué)與工程，一志愿華理能動(dòng)285求調(diào)劑已經(jīng)有10人回復(fù)
070305高分子化學(xué)與物理 304分求調(diào)劑已經(jīng)有5人回復(fù)
083000學(xué)碩274求調(diào)劑已經(jīng)有8人回復(fù)
一志愿北京化工大學(xué)材料與化工（085600）296求調(diào)劑已經(jīng)有10人回復(fù)
求調(diào)劑一志愿海大，0703化學(xué)學(xué)碩304分，有大創(chuàng)項(xiàng)目，四級(jí)已過(guò) 已經(jīng)有11人回復(fù)
071000生物學(xué)求調(diào)劑，初試成績(jī)343 已經(jīng)有7人回復(fù)
0703化學(xué)調(diào)劑，求導(dǎo)師收已經(jīng)有8人回復(fù)

» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)

» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:

關(guān)于MS和GROMACS文件轉(zhuǎn)換的問(wèn)題已經(jīng)有8人回復(fù)
關(guān)于gromacs殘基不識(shí)別的問(wèn)題已經(jīng)有17人回復(fù)
請(qǐng)問(wèn)，怎么樣生成oplsaa力場(chǎng)的top文件？已經(jīng)有6人回復(fù)
環(huán)己烷在gromacs中的gromos45a3力場(chǎng)中的itp文件怎么寫？已經(jīng)有12人回復(fù)
gromacs安裝后無(wú)法使用已經(jīng)有5人回復(fù)
用amber制作小分子力場(chǎng)參數(shù)時(shí)突然遇到的一些問(wèn)題已經(jīng)有12人回復(fù)
Gromacs中添加CHARMM力場(chǎng) 已經(jīng)有41人回復(fù)
使用amber力場(chǎng)，一些參數(shù)無(wú)法獲得已經(jīng)有5人回復(fù)
Gromacs粗�；�(chǎng)（自己寫）已經(jīng)有11人回復(fù)
離子液體模擬：如何從別的軟件移植力場(chǎng)到Gromacs（itp文件的含義以及如何寫itp文件）已經(jīng)有4人回復(fù)
請(qǐng)問(wèn)有沒(méi)有小分子數(shù)據(jù)庫(kù)可以直接下載相關(guān)的力場(chǎng)參數(shù)文件的？已經(jīng)有3人回復(fù)
gromacs無(wú)法生成gro文件已經(jīng)有5人回復(fù)
gromacs自己添加residue遇到的問(wèn)題已經(jīng)有6人回復(fù)
gromacs 模擬NPT系宗出問(wèn)題已經(jīng)有8人回復(fù)
gromacs，用pdb文件生成top文件時(shí)遇到的問(wèn)題已經(jīng)有4人回復(fù)
gromacs或者VMD中怎么截取特定的面？已經(jīng)有8人回復(fù)
gromacs oplsaa 力場(chǎng)中的原子類型已經(jīng)有6人回復(fù)
如何用MS的納米管坐標(biāo)轉(zhuǎn)到gromacs可識(shí)別的文件已經(jīng)有7人回復(fù)
GROMACS 小分子top文件已經(jīng)有9人回復(fù)
求Gromacs中Glycam力場(chǎng)數(shù)據(jù)包。。非常感謝已經(jīng)有5人回復(fù)
gromacs全原子力場(chǎng)不能跑，求助！已經(jīng)有6人回復(fù)
如何獲取力場(chǎng)參數(shù)文件？已經(jīng)有4人回復(fù)
【轉(zhuǎn)帖】GROMACS分析程序討論，在gromacs中添加Amber力場(chǎng) 已經(jīng)有8人回復(fù)
【原創(chuàng)】在gromacs的gro中插入小分子已經(jīng)有12人回復(fù)
【求助】gromacs出現(xiàn)了一個(gè)問(wèn)題已經(jīng)有10人回復(fù)
【求助】求助Gromacs中關(guān)于g_hbond的out文件的問(wèn)題已經(jīng)有10人回復(fù)

我來(lái)了~~

1樓 2015-04-11 10:56:06

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

tbw258

銅蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 3 (幼兒園)
金幣: 183.5
散金: 10
帖子: 44
在線: 36.3小時(shí)
蟲號(hào): 2537455
注冊(cè): 2013-07-08
性別: GG
專業(yè): 藥物設(shè)計(jì)與藥物信息

acpype 可以生成框架的.itp 但是里面的關(guān)于非標(biāo)準(zhǔn)原子B的內(nèi)容全為0 可以的話你就以笨硼酸為例子試試看

贊一下

回復(fù)此樓

我來(lái)了~~

3樓2015-04-16 10:52:25

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

查看全部 4 個(gè)回答

smutao

禁蟲 (著名寫手)

★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
tbw258(abinitio代發(fā)): 金幣+5, 鼓勵(lì)交流. 正解 2015-04-13 10:59:38

本帖內(nèi)容被屏蔽

2樓2015-04-11 22:55:36

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

tbw258

銅蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 3 (幼兒園)
金幣: 183.5
散金: 10
帖子: 44
在線: 36.3小時(shí)
蟲號(hào): 2537455
注冊(cè): 2013-07-08
性別: GG
專業(yè): 藥物設(shè)計(jì)與藥物信息

這個(gè)貼在要涔了問(wèn)題還沒(méi)解決呢

贊一下

回復(fù)此樓

我來(lái)了~~

4樓2015-04-17 21:35:20

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

查看全部 4 個(gè)回答

最具人氣熱帖推薦 [查看全部]		作者	回/看	最后發(fā)表

[考研] 0703化學(xué)求調(diào)劑 +9	奶油草莓. 2026-03-22	10/500	2026-03-28 13:30 by 唐沐兒
[考研] 材料277求調(diào)劑 +7	min3 2026-03-24	7/350	2026-03-28 11:39 by xuxiang
[考研] 291求調(diào)劑 +15	hhhhxn.. 2026-03-23	21/1050	2026-03-28 11:26 by self2008
[考研] 一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑 +7	hanamiko 2026-03-27	7/350	2026-03-28 09:56 by 李上岸0921
[考研] 086000調(diào)劑 +3	7901117076 2026-03-26	3/150	2026-03-27 21:34 by Jianing_Mi
[考研] 一志愿211院校 344分東北農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)學(xué)碩，求調(diào)劑 +5	丶風(fēng)雪夜歸人丶 2026-03-26	8/400	2026-03-27 19:22 by 丶風(fēng)雪夜歸人丶
[考研] 266求調(diào)劑 +11	陽(yáng)陽(yáng)哇塞 2026-03-27	12/600	2026-03-27 17:56 by yu221
[考研] 化學(xué)308分求調(diào)劑 +8	你好明天你好 2026-03-23	9/450	2026-03-27 14:01 by 楊光于青云
[考研] 一志愿211，335分，0856，求調(diào)劑院校和導(dǎo)師 +4	傾____蕭 2026-03-27	5/250	2026-03-27 11:52 by zhshch
[考研] 0703化學(xué)一志愿南京師范大學(xué)303求調(diào)劑 +3	zzffylgg 2026-03-24	3/150	2026-03-27 10:42 by shangxh
[考研] 292求調(diào)劑 +4	求求了收下我吧?/a> 2026-03-26	4/200	2026-03-27 10:37 by zhshch
[考研] 0703化學(xué)338求調(diào)劑！ +6	Zuhui0306 2026-03-26	7/350	2026-03-27 10:35 by shangxh
[考研] 一志愿陜師大生物學(xué)071000，298分，求調(diào)劑 +5	SYA！ 2026-03-23	5/250	2026-03-27 09:29 by 不吃魚的貓
[考研] 343求調(diào)劑 +4	贈(zèng)我一本書 2026-03-23	4/200	2026-03-27 00:40 by wxiongid
[考研] 一志愿鄭州大學(xué)，080500學(xué)碩，總分317分求調(diào)劑 +4	舉個(gè)栗子oi 2026-03-24	5/250	2026-03-26 23:15 by 不吃魚的貓
[考研] 333求調(diào)劑 +6	wfh030413@ 2026-03-23	6/300	2026-03-26 22:45 by 學(xué)員8dgXkO
[考研] 281求調(diào)劑 +6	Koxui 2026-03-24	7/350	2026-03-26 15:37 by 無(wú)際的草原
[考研] 求調(diào)劑 +3	李李不服輸 2026-03-25	3/150	2026-03-25 13:03 by cmz0325
[考研] 材料考研調(diào)劑生 +3	黃粱一夢(mèng)千年 2026-03-24	3/150	2026-03-24 17:00 by barlinike
[考研] 一志愿山東大學(xué)藥學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑 +3	開開心心沒(méi)煩惱 2026-03-23	4/200	2026-03-24 00:06 by 開開心心沒(méi)煩惱