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seamas_gao1銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
剛拿到全基因組，想做全基因組關(guān)聯(lián)分析，需要準(zhǔn)備什么？ 已有2人參與
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我們大課題組干了快兩年，馬上就要拿到一個(gè)養(yǎng)殖動(dòng)物的全基因組了。現(xiàn)在在計(jì)劃下一步的方向。小弟對(duì)這個(gè)方向不是太懂，想請(qǐng)教一下，如果做全基因組關(guān)聯(lián)分析，是否還要先做高密度snp芯片？還需要準(zhǔn)備什么前期工作？謝謝！ [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
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seamas_gao1
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2樓2015-05-11 17:47:59
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seamas_gao1
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5樓2015-05-20 08:33:05
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seamas_gao1: 金幣+80, ★★★★★最佳答案 2015-05-25 08:30:20
seamas_gao1: 金幣+80, ★★★★★最佳答案 2015-05-25 08:30:20
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做GWAS很燒錢的噢。你這個(gè)不是模式生物，沒有現(xiàn)成的商業(yè)化芯片，要自己定制，那還不如直接上重測(cè)序做GWAS。GWAS最關(guān)鍵的就是性狀調(diào)查，一定要準(zhǔn)確。后面的數(shù)據(jù)分析都是成熟的套路了。 如果沒那么多錢，就好好挖一下基因組吧。仔細(xì)讀讀近五六年在Nature、Science、NG等高水平期刊上發(fā)的全基因組測(cè)序論文，然后對(duì)比一下DNA Res這種低水平期刊上的基因組測(cè)序論文，好好學(xué)學(xué)牛人們是怎么用基因組做功能、編故事的。 |
6樓2015-05-20 14:03:40
wangningbo
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7樓2016-09-29 11:39:46
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