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yukki_0818新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
關(guān)于multiwfn里ADCH的一些疑問(wèn) 已有1人參與
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最近剛?cè)肓炕?jì)算坑，真是大坑。 我在算分子以及激發(fā)態(tài)的偶極矩，準(zhǔn)確來(lái)說(shuō)是鍵偶極矩。研究思路是高斯計(jì)算→得出wfn文件→multiwfn查看ADCH→記錄每個(gè)原子的電荷分布→乘以鍵長(zhǎng)=鍵偶極矩（偶極矩定義是正負(fù)電中心距離x電荷嘛）。然后問(wèn)題出現(xiàn)了。 1.中性分子，但原子的正負(fù)電荷全加起來(lái)并不嚴(yán)格等于0，有時(shí)甚至一模一樣的化學(xué)鍵電荷都不同（比如CH4里四個(gè)氫的電荷分布不一樣）。老師說(shuō)真是保留位數(shù)不同沒(méi)什么影響，這真的沒(méi)影響嗎？ 2.一個(gè)與正電原子相連的另一原子必須帶負(fù)電嗎？比如NH2F，算出來(lái)N和F都是帶負(fù)電的，這就不知道該怎么分配電荷來(lái)計(jì)算N-F鍵的偶極矩了。 請(qǐng)求前輩們指導(dǎo)一下，或者給點(diǎn)解決方案。謝謝了�。。。�！ |
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yongleli
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990: 金幣+3, 感謝應(yīng)助 2015-05-16 17:14:15
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1. 不同的電荷功能不同。ESP電荷只是考慮到了分子周?chē)撵o電勢(shì)，對(duì)分子內(nèi)部相互作用的描述不靠譜。ChelpG貌似原理上更優(yōu)，考慮到了分子內(nèi)部的靜電勢(shì)分布；但是結(jié)果跟ESP差不多。NBO電荷只是給有機(jī)化學(xué)家看的，電荷數(shù)值偏大。AIM常常給出超出正常范圍的電荷，比如氧有時(shí)有絕對(duì)值大于1.0電荷。而且，以上電荷都主要用于討論分子間相互作用。 2. 相同種類(lèi)的原子附近，在分子中的電子云分布不同，坐標(biāo)不同，得到的電荷就會(huì)有差別。只有做進(jìn)一步的約束計(jì)算才能得到具有對(duì)稱(chēng)性的電荷。 請(qǐng)參考MacKerel的主頁(yè)，和RED網(wǎng)頁(yè)： http://q4md-forcefieldtools.org/RED/ 3. 研究分子內(nèi)局域性質(zhì)，計(jì)算電荷不是個(gè)好辦法。因?yàn)殡姾刹皇俏锢砜蓽y(cè)量，定義具有隨意性。建議多查文獻(xiàn)多看看別人是怎么做的。 |
2樓2015-05-16 08:36:40
yongleli
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【答案】應(yīng)助回帖
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gmy1990: 金幣+3, 謝謝交流 2015-05-16 17:14:26
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AIM文獻(xiàn)推薦： http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/jp001062e http://www.uwyo.edu/kubelka-chem/population_analysis.pdf http://www.lct.jussieu.fr/manuels/Gaussian98/00000415.htm (Gaussian成員中，開(kāi)發(fā)AIM的人2000年左右離開(kāi)了Gaussian公司，導(dǎo)致AIM功能不全。但是對(duì)于簡(jiǎn)單體系，仍然可以做AIM分析。) https://notendur.hi.is//~egillsk ... der_pres_150206.pdf 還有個(gè)ELF（electron localization function）分析也可以試試。 http://www2.cpfs.mpg.de/ELF/index.php http://onlinelibrary.wiley.com/d ... 7610709.ch6/summary |
3樓2015-05-16 08:41:15
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