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caojinli

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[求助] VASP中PBS的腳本文件關(guān)于mpirun的看不懂哪位大神幫忙解決解決已有2人參與

我們服務(wù)器的PBS腳本文件：
#PBS -l nodes=1:ppn=16
#PBS -j oe
cd $PBS_O_WORKDIR
NSLOTS=`cat ${PBS_NODEFILE} | wc -l`
mpirun -np $NSLOTS -machinefile $PBS_NODEFILE /data1/soft/bin/vasp.openmpi
前三行都能看懂，后面兩行（路徑除外）看不懂什么意思，哪位大神幫幫忙？？求解答

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1樓 2015-06-16 22:43:45

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KalaShayminS

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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
caojinli: 金幣+10, ★★★很有幫助 2015-06-17 08:41:49

進(jìn)入到執(zhí)行程序的文件夾
計(jì)算進(jìn)程數(shù)
mpirun啟動(dòng)vasp程序

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2樓2015-06-16 23:31:42

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caojinli

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2樓: Originally posted by KalaShayminS at 2015-06-16 23:31:42
進(jìn)入到執(zhí)行程序的文件夾
計(jì)算進(jìn)程數(shù)
mpirun啟動(dòng)vasp程序

NSLOTS=`cat ${PBS_NODEFILE} | wc -l`
mpirun -np $NSLOTS -machinefile $PBS_NODEFILE
這兩行里面第一行是命名變量嗎？第二行是什么？？

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3樓2015-06-17 08:43:26

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wmy8802217

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

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3樓: Originally posted by caojinli at 2015-06-17 08:43:26
NSLOTS=`cat ${PBS_NODEFILE} | wc -l`
mpirun -np $NSLOTS -machinefile $PBS_NODEFILE
這兩行里面第一行是命名變量嗎？第二行是什么？？...

第一行是得到多少個(gè)核并行，-machinefile 我估計(jì)是指定哪個(gè)節(jié)點(diǎn)運(yùn)行

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4樓2015-06-17 08:58:54

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納蘭嫣然

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5樓2015-06-17 14:27:18

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