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如何計算分子間的弱相互作用以及分析氫鍵 已有2人參與
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如題 如何計算分子間的弱相互作用以及分析氫鍵 大家好，最近我在用gaussian軟件計算分子間的相互作用，但是對于操作步驟現(xiàn)在還是不太確定是不是正確的，所以向各位大牛詳細(xì)請教一下。 現(xiàn)在我把我的計算步驟詳細(xì)說一下 1）比如兩個分子，分別稱為分子A和分子B，兩個分子之間會形成氫鍵作用 2）我用gaussian軟件用B3LYP/6-311+G*基組分別計算了只有分子A存在的能量E(A)、只有分子B存在的能量E(B)以及同時存在兩個分子（即分子A和分子B）的能量E(AB) 3）最后計算 認(rèn)為E(AB)-E(A)-E(B)的絕對值是分子間的弱相互作用， 這樣的計算方法對不對，還是說要加上BSSE修正E(BSSE)就行了 即|E(AB)-E(A)-E(B)|+E(BSSE) 請大家不吝賜教，在此謝謝大家了 |
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9樓2015-06-25 09:25:18
kong890109
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gmy1990: 金幣+2, 感謝應(yīng)助 2015-06-24 17:09:32
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| 需要BSSE校正，具體的弱相互作用分析方法可以參看此貼http://www.gaoyang168.com/html/201408/7827455.html；使用過這里面的RDG方法，感覺挺形象的，你可以試試。 |
2樓2015-06-22 20:06:50
zhou2009
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十年磨練: 金幣+5, ★有幫助 2015-11-03 09:32:15
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B3LYP算氫鍵并不那么合用（參見“亂談DFT-D”：http://sobereva.com/83），如果起點(diǎn)不高，計算結(jié)果很難說。 不知分子體系有多大。最起碼要用b97d。最好用DFT-D。如果氫鍵體系較小，可以用mp4(sdtq)或者CCSD。 |
3樓2015-06-23 10:23:29
4樓2015-06-23 10:36:26
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