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我恨果凍鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
建ML樹如何選定模型 已有3人參與
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我使用RaxML進(jìn)行ML樹構(gòu)建，但是在輸入命令的時(shí)候，-m后面的模型不知道怎么選擇，RaxML提供的模型有這幾種：GTRCAT，GTRMIX，GTRGAMMA，GTRCAT_GAMMA， GTRGAMMAI，GTRMIXI，GTRCAT GAMMAI。我用jModelTest算出來每一個(gè)序列的最優(yōu)模型了，可是jModelTest里都是HKY+G或者TPM1uf+I+G這樣的。我不知道面對(duì)具體的某一個(gè)文件，該怎么選擇RaxML里的模型。 請(qǐng)知道的前輩們幫幫我，謝謝！ |
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澈野
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2樓2015-12-25 16:01:33
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3樓2016-01-04 10:51:56
whynot2015
木蟲 (小有名氣)
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7樓2018-06-26 10:03:46
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