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我恨果凍鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
建ML樹如何選定模型 已有3人參與
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我使用RaxML進行ML樹構(gòu)建,但是在輸入命令的時候,-m后面的模型不知道怎么選擇,RaxML提供的模型有這幾種:GTRCAT,GTRMIX,GTRGAMMA,GTRCAT_GAMMA, GTRGAMMAI,GTRMIXI,GTRCAT GAMMAI。我用jModelTest算出來每一個序列的最優(yōu)模型了,可是jModelTest里都是HKY+G或者TPM1uf+I+G這樣的。我不知道面對具體的某一個文件,該怎么選擇RaxML里的模型。 請知道的前輩們幫幫我,謝謝! |
木蟲 (小有名氣)
木蟲 (正式寫手)

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