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dxl20132009銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
amber 里生成pdb文件的命令 已有2人參與
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| 我想看看跑完平衡后的結(jié)構(gòu),但是沒有pdb文件,只有rst文件,看教程里說(shuō)用AMBERHOME/bin/ambpdb -p polyAT_wat.prmtop < polyAT_wat.inpcrd > polyAT_wat.pdb,但是我輸入后沒有反應(yīng),怎么回事?能不能在跑平衡的腳本里加上一些關(guān)鍵詞什么的,讓它算完后,把最后一幀的結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化為pdb格式的文件? |
新蟲 (初入文壇)
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銅蟲 (小有名氣)
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