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小胖芙芙新蟲 (初入文壇)
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[求助]
求助。《唐危169 bp)PCR擴(kuò)增,用Takara La Taq酶,不出條帶呀。。。。 已有5人參與
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![]() ![]() 小白第一次發(fā)帖,各位大神見諒。。。。以前用普通的2×Taq PCR Mix擴(kuò)增,它含的酶是Taq DNA Polymerase,擴(kuò)增條帶是169 bp,當(dāng)時(shí)可以出條帶,亮度可以。也送測(cè)了的,返回結(jié)果有的位點(diǎn)是雙峰。 因?yàn)樘岬腄NA是混合物,現(xiàn)在想做克隆看看混合物的成分,就換成了Takara的La taq,但是不出條帶了呀。。。引物沒變,PCR條件也沒變。。。。 我的條件是這樣的: (1)94℃ 5min (2)94℃ 30s (3)51 ℃ 30s (4)72℃ 45s (5)(2)-(4)39 (6)72℃ 10min (7)4℃ forever 求各位大神幫幫忙,看看有沒有啥問題啊。。。。 ![]() ![]() ![]() ![]() 有啥沒說到的,各位大神盡管問。。。。。 |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
木蟲 (著名寫手)
新蟲 (小有名氣)
新蟲 (正式寫手)
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重新摸索條件是正道,這么點(diǎn)兒的片段用LA Taq有點(diǎn)兒浪費(fèi)了。Anyway,最忌諱這種一個(gè)條件P到底的情況。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |

至尊木蟲 (著名寫手)
至尊木蟲 (職業(yè)作家)
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第一點(diǎn),雙峰的結(jié)果是不是你想要的結(jié)果?不是的話,麻煩你的引物重新設(shè)計(jì),不夠特異性,第二點(diǎn),你可以用高保真酶就可以啊,La酶是長(zhǎng)片段擴(kuò)增用的吧? 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
木蟲 (著名寫手)
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不到200的片段用普通酶應(yīng)該可以拿到正確的序列的,突變率還是比較低的,對(duì)于你測(cè)序是雙峰,不知道你送測(cè)的樣品是什么?測(cè)序結(jié)果一點(diǎn)正確的都沒有?如果是PCR產(chǎn)物,建議將pcr產(chǎn)物進(jìn)行膠回收或者過柱純化后測(cè)序,另一個(gè)辦法即將pcr產(chǎn)物連接到T載體測(cè)序。另外實(shí)驗(yàn)中不同的酶更換后,條件還是要重新摸索的,特別退火溫度,因?yàn)榻?jīng)常會(huì)出現(xiàn)普通酶可以而高保真的酶不行。我不太清楚第二種酶的延伸速度,不到200的片段應(yīng)該不用那么長(zhǎng)延伸時(shí)間吧,循環(huán)數(shù)也適當(dāng)減少些,祝好! 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |

新蟲 (初入文壇)
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溶液體系是: LA Taq 0.25微升 pcr buffer 2.5微升 dNTP Mix 2微升 primers 1/1微升 ddH2O 17.25微升 DNA 1微升 對(duì)了,LA taq是125U的 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
新蟲 (初入文壇)
送紅花一朵 |
開始想的是用LA就可以不用單獨(dú)加A尾了,它確實(shí)是擴(kuò)長(zhǎng)的,以前用它擴(kuò)過500bp的片段是沒有問題的。循環(huán)數(shù)我也試著降一下吧,謝謝。。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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