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prthefu木蟲 (著名寫手)
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[交流]
ORF finder 翻譯氨基酸，為什么顯示的是反向序列翻成的氨基酸呢 已有3人參與
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我手上有一段蛋白的基因，師兄說給的我是全長。 然后，我在ORF finder上輸入后找ORF,出的結果如下圖1，首先，找到的ORF有那么多，而且前面frame有什么+1、-1、+2、-2、+3、-3，不懂什么意思，我只是覺得最長的可能是自己需要的。所以，我點開了最長的那個，有了序列后，發(fā)現(xiàn)下面的序列編號是倒著呢，而且和我之前輸入的序列還是反向互補的。 這是為什么？？？ 求解？？？ 360截圖20160323144023005.jpg 360截圖20160323144053343.jpg |
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Sunshine092
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| 你最好問問你師兄啊。有可能他給的序列就是這個基因的反向互補序列，將你師兄給你的序列 反向互補之后 再去ORF finder 網(wǎng)站上去看一下，把那個最長的氨基酸序列去NCBI blast 一下http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome 看這個氨基酸序列與別的物種相同基因編碼的氨基酸序列的相似度如何。 |
2樓2016-03-24 10:37:35
534720018
至尊木蟲 (著名寫手)
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3樓2016-03-24 10:43:24
prthefu
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4樓2016-03-24 17:09:32
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你好我想問一下，你圖里的那個是用ncbi里面的ORF finder弄出來的嗎？為什么我出來不是這樣的呀？求指教 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
5樓2017-10-12 14:22:42
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