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prthefu木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[交流]
ORF finder 翻譯氨基酸，為什么顯示的是反向序列翻成的氨基酸呢 已有3人參與
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我手上有一段蛋白的基因，師兄說(shuō)給的我是全長(zhǎng)。 然后，我在ORF finder上輸入后找ORF,出的結(jié)果如下圖1，首先，找到的ORF有那么多，而且前面frame有什么+1、-1、+2、-2、+3、-3，不懂什么意思，我只是覺(jué)得最長(zhǎng)的可能是自己需要的。所以，我點(diǎn)開(kāi)了最長(zhǎng)的那個(gè)，有了序列后，發(fā)現(xiàn)下面的序列編號(hào)是倒著呢，而且和我之前輸入的序列還是反向互補(bǔ)的。 這是為什么？？？ 求解？？？ 360截圖20160323144023005.jpg 360截圖20160323144053343.jpg |
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534720018
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+表示正向DNA鏈，-表示反向互補(bǔ)鏈，1、2、3分別表示從第一、第二、第三個(gè)堿基開(kāi)始編碼. 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶(hù)端 |
3樓2016-03-24 10:43:24
Sunshine092
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| 你最好問(wèn)問(wèn)你師兄啊。有可能他給的序列就是這個(gè)基因的反向互補(bǔ)序列，將你師兄給你的序列 反向互補(bǔ)之后 再去ORF finder 網(wǎng)站上去看一下，把那個(gè)最長(zhǎng)的氨基酸序列去NCBI blast 一下http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome 看這個(gè)氨基酸序列與別的物種相同基因編碼的氨基酸序列的相似度如何。 |
2樓2016-03-24 10:37:35
prthefu
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4樓2016-03-24 17:09:32
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你好我想問(wèn)一下，你圖里的那個(gè)是用ncbi里面的ORF finder弄出來(lái)的嗎？為什么我出來(lái)不是這樣的呀？求指教 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
5樓2017-10-12 14:22:42
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