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[求助]
【求助】lammps模擬碰撞竟然丟失原子，難道是勢函數(shù)的問題？？ 已有2人參與
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 建了一個模型碰撞的時候一直丟失兩個原子，都要瘋了，為了檢查錯誤，直接建立了一個簡單盒子模擬碰撞，竟然還是報錯丟失兩個原子！請各路大神幫忙瞄瞄，很簡單的小程序，咋會一直報錯呢？請不要用什么截斷半徑過小，還是飛出盒子這樣的話回復(fù)我。因為我覺得完全不可能飛出盒子，步長也調(diào)到過0.00001ps，但是不解決問題，而且是周期邊界，丟失原子覺得很奇怪��！ velocity 0 0 500的時候沒問題，但是速度一提高就報錯，比如velocity 0 0 1000。實在是不知道咋辦了，所以請各路大神幫忙看看，小弟先謝過了�？赡苡行┩瑢W(xué)打開附件有問題，所以我直接把代碼粘貼出來了，勢能是lammps自帶的勢能 units metal boundary p p p atom_style atomic lattice bcc 2.855 #orient x 1 1 1 orient y -1 -1 2 orient z 1 -1 0 region box block -16 16 -15 15 -20 20 create_box 1 box mass 1 56.0 create_atoms 1 box pair_style eam/alloy pair_coeff * * Fe_mm.eam.fs Fe timestep 0.001 neighbor 1.5 bin neigh_modify every 30 delay 0 check no #displace_box all z delta -2 2 remap none compute pe all pe/atom compute dis all displace/atom dump 1 all custom 500 2.lammpstrj id type x y z vx vy vz c_pe c_dis[1] fix 3 all nvt temp 300 300 0.1 run 1000 unfix 3 write_restart dislocation.restart ——————————————————下面是restart文件 read_restart dislocation.restart lattice bcc 2.855 #orient x 1 1 1 orient y -1 -1 2 orient z 1 -1 0 pair_style eam/alloy pair_coeff * * Fe_mm.eam.fs Fe timestep 0.0001 neighbor 1.5 bin neigh_modify every 10 delay 0 check no compute pe all pe/atom compute dis all displace/atom dump 2 all custom 100 4.lammpstrj id type x y z vx vy vz c_pe c_dis[1] group kpa id 62410 velocity kpa set 0.0 0.0 1000.0 units box fix 5 all nve run 1000 unfix 5 |
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2016-04-01 10:16:49, 328.17 K
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大懶貓王浩: 金幣+300, ★★★★★最佳答案, 師兄竟然來賺金幣了，，，，不好意思，只能給師兄了。。。 2016-04-01 17:29:35
月只藍: IP檢查，初步認定為馬甲行為，涉嫌轉(zhuǎn)移金幣，違反論壇相關(guān)管理規(guī)定：http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3711903 2016-04-02 10:16:56
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月只藍: 金幣-50, 認定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個，現(xiàn)扣除50個，還需要扣除190個。 2016-04-07 13:38:49
月只藍: 金幣-50, 認定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個，現(xiàn)扣除50個，還需要扣除140個。 2016-04-07 13:39:08
月只藍: 金幣-50, 認定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個，現(xiàn)扣除50個，還需要扣除90個。 2016-04-07 13:39:34
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來來來，我來賺金幣啦~ 在輻照損傷的模擬中，在離子間距離比較小時，已經(jīng)不能用平衡態(tài)下的作用勢來描述，一般用 ZBL 來描述這個碰撞過程。比如說常用到的 tersoff/zbl 作用勢就勢就是將 Tersoff 作用勢與 ZBL 作用勢通過一個費米函數(shù)連接起來，一般 認為小于 1Å 時需要用 ZBL 描述。 P.S. eam勢木有官方的zbl銜接版本~ |
4樓2016-04-01 17:20:32
5樓2016-04-01 18:13:55
xxxxzzz
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7樓2016-12-02 15:44:09
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