 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3073 | 回復(fù): 6 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
[求助]
【求助】lammps模擬碰撞竟然丟失原子，難道是勢函數(shù)的問題？？ 已有2人參與
|
|||
 建了一個(gè)模型碰撞的時(shí)候一直丟失兩個(gè)原子，都要瘋了，為了檢查錯誤，直接建立了一個(gè)簡單盒子模擬碰撞，竟然還是報(bào)錯丟失兩個(gè)原子！請各路大神幫忙瞄瞄，很簡單的小程序，咋會一直報(bào)錯呢？請不要用什么截?cái)喟霃竭^小，還是飛出盒子這樣的話回復(fù)我。因?yàn)槲矣X得完全不可能飛出盒子，步長也調(diào)到過0.00001ps，但是不解決問題，而且是周期邊界，丟失原子覺得很奇怪啊！ velocity 0 0 500的時(shí)候沒問題，但是速度一提高就報(bào)錯，比如velocity 0 0 1000。實(shí)在是不知道咋辦了，所以請各路大神幫忙看看，小弟先謝過了。可能有些同學(xué)打開附件有問題，所以我直接把代碼粘貼出來了，勢能是lammps自帶的勢能 units metal boundary p p p atom_style atomic lattice bcc 2.855 #orient x 1 1 1 orient y -1 -1 2 orient z 1 -1 0 region box block -16 16 -15 15 -20 20 create_box 1 box mass 1 56.0 create_atoms 1 box pair_style eam/alloy pair_coeff * * Fe_mm.eam.fs Fe timestep 0.001 neighbor 1.5 bin neigh_modify every 30 delay 0 check no #displace_box all z delta -2 2 remap none compute pe all pe/atom compute dis all displace/atom dump 1 all custom 500 2.lammpstrj id type x y z vx vy vz c_pe c_dis[1] fix 3 all nvt temp 300 300 0.1 run 1000 unfix 3 write_restart dislocation.restart ——————————————————下面是restart文件 read_restart dislocation.restart lattice bcc 2.855 #orient x 1 1 1 orient y -1 -1 2 orient z 1 -1 0 pair_style eam/alloy pair_coeff * * Fe_mm.eam.fs Fe timestep 0.0001 neighbor 1.5 bin neigh_modify every 10 delay 0 check no compute pe all pe/atom compute dis all displace/atom dump 2 all custom 100 4.lammpstrj id type x y z vx vy vz c_pe c_dis[1] group kpa id 62410 velocity kpa set 0.0 0.0 1000.0 units box fix 5 all nve run 1000 unfix 5 |
回復(fù)此樓» 本帖附件資源列表
-
歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲僅提供交流平臺，不對該內(nèi)容負(fù)責(zé)。
本內(nèi)容由用戶自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識產(chǎn)權(quán)問題，其責(zé)任在于用戶本人，如對版權(quán)有異議，請聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 超簡單碰撞.zip
2016-04-01 10:16:49, 328.17 K
» 猜你喜歡
265求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
0817 化學(xué)工程 299分求調(diào)劑 有科研經(jīng)歷 有二區(qū)文章
已經(jīng)有21人回復(fù)
-
295材料求調(diào)劑，一志愿武漢理工085601專碩
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
0856調(diào)劑，是學(xué)校就去
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
298-一志愿中國農(nóng)業(yè)大學(xué)-求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
學(xué)校已經(jīng)提交到NSFC，還能修改嗎？
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
材料學(xué)碩297已過四六級求調(diào)劑推薦
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
295復(fù)試調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
本人考085602 化學(xué)工程 專碩
已經(jīng)有20人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 【求助】lammps關(guān)于fix ave/spatial命令應(yīng)用問題
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】lammps中是否有關(guān)于Bond-orientational order參數(shù)的
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【求助】Lammps使用？
已經(jīng)有0人回復(fù)
- 【求助】LAMMPS-運(yùn)行報(bào)錯
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】lammps勢的選擇
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【求助】lammps模擬聚合物刷如何建模？
已經(jīng)有1人回復(fù)
- 【求助】LAMMPS構(gòu)造晶界
已經(jīng)有0人回復(fù)
- 【求助】lammps或者dlpoly能否做粗�；M嗎？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【求助】Lammps能做布朗動力學(xué)模擬嗎？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【求助】lammps怎么算聲子譜？
已經(jīng)有1人回復(fù)
- 【求助】lammps的使用
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助】lammps 安裝問題
已經(jīng)有1人回復(fù)
- 【求助】Lammps 中加外力的問題
已經(jīng)有1人回復(fù)
- 【求助】LAMMPS中添加Lees-Edwards邊界條件
已經(jīng)有2人回復(fù)
- 【求助】lammps這段代碼的意思是？
已經(jīng)有1人回復(fù)
- 【求助】lammps計(jì)算heat/flux出錯
已經(jīng)有1人回復(fù)
- 【求助】lammps如何測量模擬以后材料的晶格參數(shù)？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【求助】LAMMPS－REAX計(jì)算出錯
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【求助】lammps中多元化合物的晶格創(chuàng)建問題
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【求助】lammps中消除平動對溫度統(tǒng)計(jì)的影響問題
已經(jīng)有2人回復(fù)
- 【求助】Lammps 多機(jī)并行的問題
已經(jīng)有11人回復(fù)
whyaquarius
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 253.8
- 散金: 70
- 帖子: 30
- 在線: 34.7小時(shí)
- 蟲號: 2175398
- 注冊: 2012-12-09
- 性別: GG
- 專業(yè): 核技術(shù)及其應(yīng)用
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
大懶貓王浩: 金幣+300, ★★★★★最佳答案, 師兄竟然來賺金幣了，，，，不好意思，只能給師兄了。。。 2016-04-01 17:29:35
月只藍(lán): IP檢查，初步認(rèn)定為馬甲行為，涉嫌轉(zhuǎn)移金幣，違反論壇相關(guān)管理規(guī)定：http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3711903 2016-04-02 10:16:56
月只藍(lán): 經(jīng)查，您和大懶貓王浩的IP地址十分相近，請于2天內(nèi)通過站內(nèi)短消息解釋您和大懶貓王浩的關(guān)系！逾期按馬甲處理，并可能追加額外金幣處罰。 2016-04-02 10:18:04
月只藍(lán): 金幣-50, 認(rèn)定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個(gè)，現(xiàn)扣除50個(gè)，還需要扣除190個(gè)。 2016-04-07 13:38:49
月只藍(lán): 金幣-50, 認(rèn)定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個(gè)，現(xiàn)扣除50個(gè)，還需要扣除140個(gè)。 2016-04-07 13:39:08
月只藍(lán): 金幣-50, 認(rèn)定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個(gè)，現(xiàn)扣除50個(gè)，還需要扣除90個(gè)。 2016-04-07 13:39:34
月只藍(lán): 金幣-50, 認(rèn)定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個(gè)，現(xiàn)扣除50個(gè)，還需要扣除40個(gè)。 2016-04-07 13:40:20
月只藍(lán): 金幣-40, 認(rèn)定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個(gè)，現(xiàn)已扣除完畢。 2016-04-07 13:40:42
月只藍(lán): 考慮到用戶可能不了解馬甲行為規(guī)定且是初犯，免除額外處罰。 2016-04-07 13:42:00
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
大懶貓王浩: 金幣+300, ★★★★★最佳答案, 師兄竟然來賺金幣了，，，，不好意思，只能給師兄了。。。 2016-04-01 17:29:35
月只藍(lán): IP檢查，初步認(rèn)定為馬甲行為，涉嫌轉(zhuǎn)移金幣，違反論壇相關(guān)管理規(guī)定：http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3711903 2016-04-02 10:16:56
月只藍(lán): 經(jīng)查，您和大懶貓王浩的IP地址十分相近，請于2天內(nèi)通過站內(nèi)短消息解釋您和大懶貓王浩的關(guān)系！逾期按馬甲處理，并可能追加額外金幣處罰。 2016-04-02 10:18:04
月只藍(lán): 金幣-50, 認(rèn)定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個(gè)，現(xiàn)扣除50個(gè)，還需要扣除190個(gè)。 2016-04-07 13:38:49
月只藍(lán): 金幣-50, 認(rèn)定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個(gè)，現(xiàn)扣除50個(gè)，還需要扣除140個(gè)。 2016-04-07 13:39:08
月只藍(lán): 金幣-50, 認(rèn)定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個(gè)，現(xiàn)扣除50個(gè)，還需要扣除90個(gè)。 2016-04-07 13:39:34
月只藍(lán): 金幣-50, 認(rèn)定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個(gè)，現(xiàn)扣除50個(gè)，還需要扣除40個(gè)。 2016-04-07 13:40:20
月只藍(lán): 金幣-40, 認(rèn)定為金幣轉(zhuǎn)移行為，核減金幣300×0.8=240個(gè)，現(xiàn)已扣除完畢。 2016-04-07 13:40:42
月只藍(lán): 考慮到用戶可能不了解馬甲行為規(guī)定且是初犯，免除額外處罰。 2016-04-07 13:42:00
|
來來來，我來賺金幣啦~ 在輻照損傷的模擬中，在離子間距離比較小時(shí)，已經(jīng)不能用平衡態(tài)下的作用勢來描述，一般用 ZBL 來描述這個(gè)碰撞過程。比如說常用到的 tersoff/zbl 作用勢就勢就是將 Tersoff 作用勢與 ZBL 作用勢通過一個(gè)費(fèi)米函數(shù)連接起來，一般 認(rèn)為小于 1Å 時(shí)需要用 ZBL 描述。 P.S. eam勢木有官方的zbl銜接版本~ |
4樓2016-04-01 17:20:32
hooge
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 1790.1
- 散金: 236
- 紅花: 1
- 帖子: 975
- 在線: 135.1小時(shí)
- 蟲號: 89636
- 注冊: 2005-08-29
- 專業(yè): 金屬材料的力學(xué)行為
2樓2016-04-01 13:09:58
3樓2016-04-01 13:15:09
5樓2016-04-01 18:13:55
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 296求調(diào)劑 +4 | www_q 2026-03-18 | 8/400 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +5 | 曼殊2266 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
[考研] 一志愿中國海洋大學(xué)，生物學(xué)，301分，求調(diào)劑 +5 | 1孫悟空 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 梁成偉老師課題組歡迎你的加入 +9 | 一鴨鴨喲 2026-03-14 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +4 | 18889395102 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑，一志愿:南京航空航天大學(xué)大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩，總分289分 +3 | @taotao 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)求調(diào)劑 +3 | 臨澤境llllll 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿福大288有機(jī)化學(xué)，求調(diào)劑 +3 | 小木蟲200408204 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿985，本科211，0817化學(xué)工程與技術(shù)319求調(diào)劑 +10 | Liwangman 2026-03-15 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 295求調(diào)劑 +3 | 一志愿京區(qū)211 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工 +5 | 安全上岸！ 2026-03-16 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +11 | 冬十三 2026-03-15 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 考研化學(xué)學(xué)碩調(diào)劑，一志愿985 +4 | 張vvvv 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +4 | 小賈同學(xué)123 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 283求調(diào)劑 +3 | 聽風(fēng)就是雨； 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] [導(dǎo)師推薦]西南科技大學(xué)國防/材料導(dǎo)師推薦 +3 | 尖角小荷 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 藥學(xué)383 求調(diào)劑 +3 | 藥學(xué)chy 2026-03-15 | 4/200 |
|
|
|
[基金申請]
今年的國基金是打分制嗎？
 50+3
|
zhanghaozhu 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 22408總分284求調(diào)劑 +3 | InAspic 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑 +4 | 奇點(diǎn)0314 2026-03-14 | 4/200 |
|