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Yakamoz325銀蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助/交流】關(guān)于使用AFLP的方法做遺傳多樣性的研究的幾個問題 已有9人參與
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銀蟲 (小有名氣)

金蟲 (正式寫手)
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銀蟲 (小有名氣)
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AFLP的實驗我們做了4年,可以和你交流下經(jīng)驗。如果你是首次做AFLP,實驗室基礎(chǔ)決定你的預(yù)算。 1.儀器 建議用伯樂的產(chǎn)品。我們用的是:伯樂sequencing cell。一套配下來估計(30萬),其中梳子和墊片很重要。 優(yōu)點是:操作簡便,特別是灌膠,制膠的過程。 2.相關(guān)試劑 首先玻璃板和托盤。一般準(zhǔn)備100-200個就夠了,注意規(guī)格。我們的是56×38的(cm);固定、漂洗、染色、脫色用的托盤要按照你玻璃板的規(guī)格而定,操作方便,不能太小也不能太大,太小,不便操作;太大,搖床的功率是問題。估計總共(700元) 其次試劑,AFLP所用是試劑很多,要注意的是:尿素的質(zhì)量;其他的藥品Acr&Bis、M剝離硅烷、親和硅烷、溴芬藍和二甲苯氰FF、TEMED、硼酸、甲醛、冰醋酸、無水碳酸鈉、硫代硫酸鈉、硝酸銀均按照技術(shù)指導(dǎo)就可以用。(1500) 第三PCR,這個就是根據(jù)你的需要了。我們用的如下:Tris、EDTA、β-巰基乙醇、PVP、CTAB、水飽和酚、MseI、EcoRI、T4 DNA連接酶、MseI adapter、EcoRI adapter、瓊脂糖、Taq聚合酶、dNTP 、 Marker;引物的數(shù)量,一般是16×16組合的。(4000) 以上說的就是從DNA提取到、酶切、連接、PCR、銀染整個過程用的藥品和具體的花費。如果實驗室有的話能節(jié)約很多,如果沒有就要買了。 建議:用一次的試劑就“借”;消耗品都是些化學(xué)試劑,便宜;DD水的質(zhì)量和數(shù)量不可小看。 3實驗設(shè)計 不知道LZ 是做什么的,我們做的是資源方面的所以工作量很大,引物數(shù)和樣品數(shù)決定決定你的預(yù)算。500個樣,一個引物組合理想的話要跑(不同規(guī)格47、73、96)8板。我們一般一人一天4個板,人力成本就少,如果你一個人做,會高。 可以這樣說,AFLP一板的成本(含人工)80左右(前提是實驗室基礎(chǔ)好),實驗過程長比較辛苦。 經(jīng)驗交流,拍磚勿狠。 |

金蟲 (正式寫手)
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