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bjlumang鐵桿木蟲 (知名作家)
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[交流]
【討論】PCR-DGGE 已有1人參與
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| 問(wèn)個(gè)問(wèn)題哈，向大家。我采用PCR-DGGE的方法從土壤中提取的總DNA中獲得了電泳圖，有幾條條帶，那么是否可以對(duì)每個(gè)條帶的DNA再測(cè)序來(lái)知道這個(gè)條帶主要是什么菌呢？用什么方法？ |
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鐵桿木蟲 (正式寫手)
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小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
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| DGGE后出來(lái)的條帶可以進(jìn)行測(cè)序，但是不一定是單一菌種的，因?yàn)镈GGE只對(duì)不同長(zhǎng)度的PCR產(chǎn)物進(jìn)行分離，長(zhǎng)度一樣的可能就分離不出來(lái)了。我一般采用兩種方法，一是DGGE割膠純化，對(duì)目的條帶割膠后再用DGGE純化得到單一條帶后再直接測(cè)序，但是這個(gè)方法比較麻煩，操作不好的話還很容易污染；再一個(gè)就是對(duì)割膠產(chǎn)物進(jìn)行克隆然后測(cè)序，也不簡(jiǎn)單呵呵。 |
2樓2010-05-08 12:32:31
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