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feitianrenwo木蟲 (著名寫手)
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[交流]
【求助/交流】求助基因克隆方面的問題解決方案 已有10人參與
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求助基因克隆方面的問題解決方案 本人正在克隆一個微生物的一個基因,設(shè)計簡并引物擴增基因組DNA,獲得了幾個DNA片段,在NCBI里比對,與一些微生物的同源性達到80%以上,我想知道有了這些DNA片段的序列,如何知道相應(yīng)的氨基酸序列呢?然后如何得到該基因的全長?(已經(jīng)知道沒有內(nèi)含子) |
木蟲 (正式寫手)
木蟲 (著名寫手)
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首先樓主要說明白,獲得的片段是從頭到尾的,還是只是一部分,就是說樓主要說明白引物是怎么設(shè)計的,在什么位置設(shè)計的,明確這一點的目的是要知道是否包含完整的閱讀框。 如果樓主PCR所用引物比較靠近兩端,就是說基本能包含完整的閱讀框,那么直接使用NCBI的ORF fineder就可以了,可以直接找到整個開放閱讀框,并且翻譯出氨基酸序列,包含起始密碼子和終止密碼子 |
木蟲 (著名寫手)
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