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zhangwuhui銅蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助/交流】基因克隆實(shí)驗(yàn)為非目的片段? 已有16人參與
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克隆實(shí)驗(yàn)問題 1、以cDNA為模板做PCR反應(yīng),得到的產(chǎn)物和預(yù)期的長(zhǎng)度一樣。 2、再用pMD-19載體連接目的片段,之后液體LB(含氨芐)200轉(zhuǎn)震蕩培養(yǎng)1-2小時(shí),取300微升倒在LB平板培養(yǎng)24小時(shí)左右,以陽(yáng)性菌落長(zhǎng)到直徑1-2毫米為止;再挑3-5個(gè)陽(yáng)性單克隆放大培養(yǎng)24小時(shí)左右。 3、裂解菌體,4°C ,12 000 g ,離心20-30分鐘,得到質(zhì)粒。 4、PCR檢測(cè)所得質(zhì)粒(引物為M13-47, RV-M),得到了目的片段大小的產(chǎn)物(稍長(zhǎng)些)。 5、送質(zhì)粒測(cè)序(使用通用引物M13-47),但是測(cè)序結(jié)果卻是如下其概況:在載體插入點(diǎn)之間的序列BLAST后,顯示為桿菌等細(xì)菌的片段,共送了10個(gè)樣品均是如此(本實(shí)驗(yàn)應(yīng)該是動(dòng)物的序列),看來不是空載,難道是載體連接上了細(xì)菌的一段序列,為什么會(huì)插入細(xì)菌片段呢,而且長(zhǎng)度就這么巧!還是其他什么原因呢,懇請(qǐng)賜教! [ Last edited by zhangwuhui on 2010-7-29 at 18:31 ] |
至尊木蟲 (著名寫手)
| 千萬別圖省事,在轉(zhuǎn)化時(shí)按照分子克隆的要求,加上載體對(duì)照、陰性對(duì)照(以LB或者SOB代替克隆基因)或無關(guān)對(duì)照(其它基因片段),這樣應(yīng)該能查出原因。而一般人做的時(shí)候,就只轉(zhuǎn)1個(gè)陽(yáng)性的。與其碰運(yùn)氣,還不如嚴(yán)格一點(diǎn)。如果載體對(duì)照甚或陰性對(duì)照也出現(xiàn)你描述的現(xiàn)象,才可以說是污染,不要亂猜,反而費(fèi)時(shí)間。 |
木蟲 (正式寫手)
金蟲 (小有名氣)
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新蟲 (初入文壇)
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