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[交流]
【求助】RMSD值 已有1人參與
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如何計(jì)算對(duì)接出的小分子配體和晶體中配體的RMSD值？ 對(duì)接出的結(jié)果只是單獨(dú)的小分子配體結(jié)構(gòu)，如果我要計(jì)算小分子和原始配體的RMSD值，是否需要將原始配體中的配體做成單獨(dú)的PDB再比較？可以采用什么方法計(jì)算出來(lái)呢？嘗試用SWISS-PDBviewer，VMD,PYMOL都沒(méi)有計(jì)算出結(jié)果，請(qǐng)問(wèn)各位有知道如何計(jì)算的嗎？ |
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2樓2010-05-17 18:12:03
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