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小木蟲論壇-學(xué)術(shù)科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » 其他 » 【求助】RMSD值
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【求助】RMSD值 已有1人參與
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如何計算對接出的小分子配體和晶體中配體的RMSD值？ 對接出的結(jié)果只是單獨的小分子配體結(jié)構(gòu)，如果我要計算小分子和原始配體的RMSD值，是否需要將原始配體中的配體做成單獨的PDB再比較？可以采用什么方法計算出來呢？嘗試用SWISS-PDBviewer，VMD,PYMOL都沒有計算出結(jié)果，請問各位有知道如何計算的嗎？ |
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2樓2010-05-17 18:12:03
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