 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2017 | 回復(fù): 11 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
[交流]
【求助/交流】關(guān)于序列去genbank比對的問題 已有9人參與
|
|||
|
看得好多蟲蟲求助關(guān)于，序列比對，ITS菌種鑒定的問題，可是好像一直都沒有得到解決啊，希望了解這一塊的同學(xué)，能給我們不是很懂的人一些指點(diǎn)，相互交流一下，誠摯感謝。 在做系統(tǒng)發(fā)育分析的時(shí)候，常遇到這么幾個(gè)問題， 1，做出來的樹不知道該如何確定待測的菌株與已知菌株的關(guān)系，也就是說如何確定該菌株是屬于這個(gè)屬或者這個(gè)科，是根據(jù)進(jìn)化距離嘛？ 2，拿自己的菌株的ITS序列去genbank比對的時(shí)候，有時(shí)候大部分是不相關(guān)的uncultured fungi，這種情況怎么找到相關(guān)的菌株啊，有一個(gè)identity值，一般多少是可用的啊，多少可以訂到屬，多少可以定到科呢？ 本人外行，剛剛涉及到這一塊，不知道大家能看懂么，也可能問題比較低級見笑了。 [ Last edited by fanta911 on 2010-7-12 at 20:14 ] |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
材料調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
考研調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
26申博
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
調(diào)劑申請
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
環(huán)境工程297分求調(diào)劑一志愿杭高院
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
070300化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
一志愿085600中科院寧波所276分求調(diào)劑
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
288資源與環(huán)境專碩求調(diào)劑，不限專業(yè)，有學(xué)上就行
已經(jīng)有22人回復(fù)
-
273求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
267求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 關(guān)于生物信息學(xué)方面，請教一個(gè)解決問題的方法
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 尋求把細(xì)菌的16s rDNA序列提交到Genbank，申請accession number 的專家-謝謝！
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 細(xì)菌鑒定--blast后一定要再到Genbank中檢索才能確定什么菌，得到accession number嗎？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 向genbank提交序列之后，收到一信件，需要提供有關(guān)樣品的信息？有人遇到過么？救贖
已經(jīng)有19人回復(fù)
- 向GENBANK提交的序列能隨后修改嗎？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 我向Genbank提交了序列并收到了登錄號，可我把那封郵件弄沒了，怎么再獲得登錄號？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【求助/交流】如何從GENBANK上查詢菌株的的Acession No
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助/交流】求關(guān)于序列上傳到GENBANK的相關(guān)問題
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助/交流】有登陸號，如何批量從Genbank中導(dǎo)出fasta格式的核酸序列
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助/交流】用sequin去GenBank申請登錄號遇到問題
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【求助/交流】請問，有沒有誰知道，如何從NCBI上批量下載一類gene的核苷酸序列？
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 【求助/交流】關(guān)于系統(tǒng)發(fā)育樹，如何鑒定菌種
已經(jīng)有12人回復(fù)
guixiaohua
禁蟲 (小有名氣)
★ ★
fanta911(金幣+1):謝謝參與
lstt09nk(金幣+1):感謝分享經(jīng)驗(yàn)~ 2010-07-12 19:18:46
fanta911(金幣+1):謝謝參與
lstt09nk(金幣+1):感謝分享經(jīng)驗(yàn)~ 2010-07-12 19:18:46
|
本帖內(nèi)容被屏蔽 |
7樓2010-07-12 19:12:07
3樓2010-07-12 12:15:17
4樓2010-07-12 12:17:58
qiangfeng
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1623.8
- 紅花: 1
- 帖子: 271
- 在線: 170.7小時(shí)
- 蟲號: 722794
- 注冊: 2009-03-14
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物化學(xué)
5樓2010-07-12 14:55:40
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +5 | Amber00 2026-03-31 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 352分-085602-一志愿985 +6 | 海納百川Ly 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +9 | 小蠟新筆 2026-03-29 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 材料科學(xué)與工程求調(diào)劑 +13 | 深V宿舍吧 2026-03-29 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 省雙一流重點(diǎn)一本大學(xué)招收調(diào)劑 +3 | wwwwffffff 2026-03-31 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿a區(qū)211，085601-307分求調(diào)劑 +10 | 黨嘉豪 2026-03-31 | 23/1150 |
|
|
|
[考研] 機(jī)械學(xué)碩總分317求調(diào)劑�。。�！ +6 | Acaciad 2026-03-25 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0856 335分 | 封裝or激光加工 老師看看我��！ +9 | cccchenso 2026-03-29 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑 +6 | hanamiko 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 322求調(diào)劑 +3 | 熹僖XX 2026-03-31 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué) +20 | 妮妮ninicgb 2026-03-27 | 20/1000 |
|
|
|
[考研] 085701求調(diào)劑初試286分 +5 | secret0328 2026-03-28 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京理工大學(xué)本科211材料工程294求調(diào)劑 +8 | mikasa的圍巾 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 復(fù)試調(diào)劑 +3 | raojunqi0129 2026-03-28 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 330一志愿中國海洋大學(xué) 化學(xué)工程 085602 有讀博意愿 求調(diào)劑 +3 | wywy.. 2026-03-27 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿上海理工能源動(dòng)力（085800）310分求調(diào)劑 +3 | zhangmingc 2026-03-27 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085600，材料與化工321分，求調(diào)劑 +9 | 大饞小子 2026-03-27 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 348求調(diào)劑 +4 | 小懶蟲不懶了 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 315調(diào)劑 +4 | 0860求調(diào)劑 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉大071010，316分求調(diào)劑 +3 | xgbiknn 2026-03-27 | 3/150 |
|