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[交流]
【求助/交流】關(guān)于反向PCR 和測序結(jié)果的拼接 已有6人參與
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最近在做反向PCR·· 用的HaeIII酶切·· 彌散性條帶 回收800-2000bp 的片段,純化,用2ng/ul 的量進(jìn)行自環(huán)化。。但是之后的反向PCR 除了第一次跑出來一個,后面一直跑不出啊。。。 我想問··· 如果反向PCR 的結(jié)果依然是彌散帶,是不是可以反復(fù)調(diào)整下體系繼續(xù)做呢? 還是如果跑不出來就需要重新進(jìn)行自環(huán)化? 不知道大家反向的PCR 的成功率一般高么? 有什么好的經(jīng)驗(yàn)么? 還有就是 反向PCR 測序的結(jié)果出來以后,應(yīng)該如何拼接呢? 如何找到片段的連接點(diǎn)? 求高人賜教·· 不甚感激! |

木蟲 (正式寫手)
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反向PCR只用一種酶不行啊 要是恰好相鄰兩個Hae III切點(diǎn)之間的片段太長,自連以后的片段長度就超出Taq的擴(kuò)增能力了,肯定P不出來條帶、彌散或者是非特異擴(kuò)增 多用幾種酶吧,至少五種以上 酶切充分一點(diǎn),不用回收,產(chǎn)物直接純化后稀釋做連接 測序結(jié)果里面肯定有一個相應(yīng)切點(diǎn)的,切點(diǎn)兩邊序列分別做反向互補(bǔ),就分別是已知片段上、下游的序列 [ Last edited by ben1147 on 2010-8-14 at 14:04 ] |
銅蟲 (正式寫手)

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