 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2200 | 回復(fù): 7 | |||
azengjuan鐵蟲 (小有名氣)
|
[交流]
【討論】含有配位鍵的金屬原子在gaussian中如何計(jì)算單點(diǎn)能
|
大家好，我想用gaussian計(jì)算一個(gè)含ligand的蛋白體系的單點(diǎn)能，ligand的部分如圖： ，ligand和蛋白之間存在化學(xué)鍵，有誰知道我該怎么處理，謝謝 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
求助立方晶體In(OH)3的CIF卡片
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
CSC訪學(xué)博后項(xiàng)目獲批，外方學(xué)校暫停合作該怎么辦？
已經(jīng)有51人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有208人回復(fù)
-
[電子教材]天津大學(xué)物理化學(xué)（第七版）上、下冊
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
陰離子交換膜電解二氧化碳還原
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
分子動(dòng)力學(xué)模擬合作需求
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
九江學(xué)院2026年最新高層次人才招聘公告
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
深圳信息職業(yè)技術(shù)學(xué)院2026年教師招聘公告（最新）
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
研究生招生
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- Gaussian幾何優(yōu)化后的鍵長不合理
已經(jīng)有41人回復(fù)
- 求高斯計(jì)算中配位鍵如何畫
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【整理】今天整理硬盤上的資料，偶然發(fā)現(xiàn)的好玩的小東西就直接發(fā)上來吧
已經(jīng)有105人回復(fù)
- 【求助】在Gaussianview中過渡金屬形成的配位鍵如何表示，就用系統(tǒng)里的單鍵表示嗎？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【分享】學(xué)習(xí)小結(jié)，高手不必進(jìn)啊
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【sobereva個(gè)人文集】電子定域性的圖形分析
已經(jīng)有56人回復(fù)
- 【求助】金屬配合物
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【求助】前線軌道研究反應(yīng)選擇性的問題
已經(jīng)有24人回復(fù)
manson1998
金蟲 (著名寫手)
OLED達(dá)人
- QC強(qiáng)帖: 1
- 應(yīng)助: 5 (幼兒園)
- 貴賓: 0.013
- 金幣: 587.4
- 散金: 1243
- 紅花: 7
- 沙發(fā): 1
- 帖子: 1402
- 在線: 451.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 687411
- 注冊: 2009-01-04
- 性別: GG
- 專業(yè): 有機(jī)分子功能材料化學(xué)
2樓2010-09-14 08:53:03
azengjuan
鐵蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 650.5
- 散金: 106
- 帖子: 65
- 在線: 78.7小時(shí)
- 蟲號(hào): 1058464
- 注冊: 2010-07-15
- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
3樓2010-09-14 09:54:06
manson1998
金蟲 (著名寫手)
OLED達(dá)人
- QC強(qiáng)帖: 1
- 應(yīng)助: 5 (幼兒園)
- 貴賓: 0.013
- 金幣: 587.4
- 散金: 1243
- 紅花: 7
- 沙發(fā): 1
- 帖子: 1402
- 在線: 451.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 687411
- 注冊: 2009-01-04
- 性別: GG
- 專業(yè): 有機(jī)分子功能材料化學(xué)
azengjuan(金幣+5): 2010-09-15 09:33:45
| 看你關(guān)注的核心結(jié)構(gòu)是什么。oniom可以進(jìn)行分子力學(xué)/量子力學(xué)的混合計(jì)算。也就是對(duì)體系的不重要的部分(外層)采用低級(jí)別的計(jì)算方法(如分子力學(xué)MM),對(duì)體系的重要的部分(內(nèi)層)采用高級(jí)別的計(jì)算方法(當(dāng)然也可以分為三層，內(nèi)中外)。這樣可以大大減小計(jì)算量。 對(duì)于你的體系，建議你將ligand、蛋白的活性部位以及l(fā)igand和蛋白相連的部位化作內(nèi)層用量化的方法計(jì)算(DFT/B3LYP),其他部分作外層用MM方法。必要的話可以嘗試優(yōu)化一下得到合理結(jié)構(gòu)的單點(diǎn)能。 ONIOM的方法在gaussian里有，具體說明可參看手冊。 |
4樓2010-09-14 10:03:49
azengjuan
鐵蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 650.5
- 散金: 106
- 帖子: 65
- 在線: 78.7小時(shí)
- 蟲號(hào): 1058464
- 注冊: 2010-07-15
- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
5樓2010-09-15 09:35:19
小丁0912
金蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1443.1
- 散金: 343
- 紅花: 5
- 沙發(fā): 1
- 帖子: 362
- 在線: 144.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 1074893
- 注冊: 2010-08-15
- 專業(yè): 高分子合成化學(xué)
6樓2010-09-17 18:54:29
manson1998
金蟲 (著名寫手)
OLED達(dá)人
- QC強(qiáng)帖: 1
- 應(yīng)助: 5 (幼兒園)
- 貴賓: 0.013
- 金幣: 587.4
- 散金: 1243
- 紅花: 7
- 沙發(fā): 1
- 帖子: 1402
- 在線: 451.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 687411
- 注冊: 2009-01-04
- 性別: GG
- 專業(yè): 有機(jī)分子功能材料化學(xué)
7樓2010-09-19 08:57:44
水兒CoCo
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 12 (小學(xué)生)
- 金幣: 2597.7
- 紅花: 7
- 帖子: 120
- 在線: 96.8小時(shí)
- 蟲號(hào): 2718708
- 注冊: 2013-10-12
- 性別: MM
- 專業(yè): 藥物化學(xué)
8樓2015-05-23 10:46:40
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 azengjuan 的主題更新
| 8 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 281求調(diào)劑（0805） +3 | 煙汐憶海 2026-03-16 | 8/400 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 301求調(diào)劑 +6 | yy要上岸呀 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
[考博] 26博士申請 +3 | 1042136743 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 268求調(diào)劑 +7 | 好運(yùn)連綿不絕 2026-03-12 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 材料與化工求調(diào)劑 +6 | 為學(xué)666 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +8 | 小熊joy 2026-03-14 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 312求調(diào)劑 +4 | 陌宸希 2026-03-16 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工求調(diào)劑 +5 | 緒幸與子 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +3 | p asserby. 2026-03-15 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑 +7 | 邱gl 2026-03-11 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 一志愿，福州大學(xué)材料專碩339分求調(diào)劑 +3 | 木子momo青爭 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研]
 11408 一志愿西電，277分求調(diào)劑
+3
|
zhouzhen654 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 機(jī)械專碩325，尋找調(diào)劑院校 +3 | y9999 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +5 | 素年祭語 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +4 | ahbd 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 本科南京大學(xué)一志愿川大藥學(xué)327 +3 | 麥田耕者 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[基金申請]
有必要更換申報(bào)口嗎
 20+3
|
fannyamoy 2026-03-11 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工（0856）304求B區(qū)調(diào)劑 +6 | 邱gl 2026-03-12 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 求材料調(diào)劑 085600英一數(shù)二總分302 前三科235 精通機(jī)器學(xué)習(xí) 一志愿哈工大 +4 | 林yaxin 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[論文投稿]
投稿問題
5+4
|
星光燦爛xt 2026-03-12 | 6/300 |
|