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xk6891至尊木蟲 (著名寫手)
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[交流]
【討論】關于md中系統(tǒng)穩(wěn)定的問題 已有3人參與
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小蟲初涉md，問一個弱弱的問題 作完結構優(yōu)化之后，看很多網(wǎng)上的資料都要求系統(tǒng)在熱浴的環(huán)境中（是不是準確的應該說是在一定的系綜下）跑一會兒，意思是說希望系統(tǒng)能在這個環(huán)境中穩(wěn)定，如何判斷系統(tǒng)在這個環(huán)境中是否達到了穩(wěn)定？穩(wěn)定之后，在做以下的性質(zhì)計算時，是否還需要這個系綜（譬如Nose Hoover熱浴）的關鍵詞？ 急盼各位高手拍磚，謝謝  |
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xk6891
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zh1987hs(金幣+3):鼓勵交流 2010-10-13 18:59:19
zh1987hs(金幣+3):鼓勵交流 2010-10-13 18:59:19
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先謝謝指導，呵呵，提的問題太不專業(yè)了。是平衡態(tài)，這一點應該說明�？梢赃@樣說么，譬如NVT系綜，md結果當中ions的溫度和electrons的動能應該在nose hoover設定的溫度和動能值附近震蕩，且粒子數(shù)目和所計算系統(tǒng)體積（晶胞大�。┎蛔�，這就可以說這個系統(tǒng)符合了NVT的系綜，這個系統(tǒng)就穩(wěn)定了。而如果是NPT系綜就看輸出文件中系統(tǒng)的壓力和溫度值的變化，如果其在設定值周圍震蕩，就可以說系統(tǒng)平衡了。 同時由于系統(tǒng)已經(jīng)平衡了，可以認為系統(tǒng)已經(jīng)滿足了熱力學極限的條件，此時在什么系綜下已經(jīng)不重要了，因為各個系綜的情況已經(jīng)相同。按照在某一系綜下穩(wěn)定的系統(tǒng)，再計算性質(zhì)，加不加關鍵詞以不重要。 不知這樣理解是否正確？還請賜教  |
4樓2010-10-13 18:40:35
xk6891
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不好意思，自己頂一下 2樓2010-10-13 13:12:04
manutdhk
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ghcacj(金幣+4):謝謝 2010-10-13 17:02:14
xk6891(金幣+5): 2010-10-13 18:18:06
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
ghcacj(金幣+4):謝謝 2010-10-13 17:02:14
xk6891(金幣+5): 2010-10-13 18:18:06
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首先，不知道你要做什么性質(zhì)的計算，平衡態(tài)還是非平衡態(tài)？ 如果是平衡態(tài)的計算，所謂的穩(wěn)定，確切地說應該是 熱力學平衡。對于一個熱力學系統(tǒng)，平衡是指 系統(tǒng)達到 吉布斯分布。NVT系綜下，系統(tǒng)的溫度與 熱浴溫度一致，能量在一定平衡值附近振蕩……等等。 至于計算平衡態(tài)性質(zhì)，是否需要繼續(xù)保持該系綜，理論上來說 其實問題不大。根據(jù)統(tǒng)計物理學原理，NVE系綜和NVT系綜，在熱力學極限下，得到的結果是相一致的。 |
3樓2010-10-13 15:36:56
manutdhk
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zh1987hs(金幣+4):謝謝 2010-10-13 18:59:32
xk6891(金幣+5):再次感謝 2010-10-13 22:49:12
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
zh1987hs(金幣+4):謝謝 2010-10-13 18:59:32
xk6891(金幣+5):再次感謝 2010-10-13 22:49:12
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對，大體是這樣的。 有點小錯誤：NVT系綜，要看 壓強隨時間的振蕩； NPT系綜，要看體積隨時間的振蕩。 我上個帖子提到的 熱力學平衡的判據(jù) 只是理論上的。 在MD 過程中，很難跟蹤整個體系是不是處于 吉布斯分布。而溫度，能量的判據(jù)是常用的。因為溫度或者能量，原本就是吉布斯分布中的參數(shù)，或者說是 可觀測量，或者說是 一階矩。更細致一點的，可能還有 二階矩，譬如 能量的振蕩幅度，對應的是比熱之類的物理量。 以上這些判據(jù)，我個人認為，實質(zhì)上就是將 吉布斯分布做一個泰勒式的展開 的函數(shù)逼近。 一階矩對應這個展開的零階項，二階矩對應的是二階項……等等。 |
5樓2010-10-13 18:53:22
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