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chemzhh至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[交流]
【討論】關(guān)于如何優(yōu)化大體系的問(wèn)題 已有4人參與
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大家看如下優(yōu)化大體系的想法如何 1先用小基組對(duì)體系做一個(gè)優(yōu)化，然后將其結(jié)果作為初始結(jié)構(gòu)用大基組再次優(yōu)化。這樣做可行嗎？能不能節(jié)省計(jì)算時(shí)間？我有點(diǎn)擔(dān)心小基組計(jì)算的結(jié)果有時(shí)候會(huì)不會(huì)誤入歧途，用作初始結(jié)構(gòu)給大基組計(jì)算反而得不到真正的結(jié)果 2用小基組優(yōu)化真實(shí)體系，或者用大基組優(yōu)化簡(jiǎn)化后的體系(例如用PMe3代替PPh3)，或者對(duì)真實(shí)體系用ONIOM處理，這三者哪一種要好一些。我也覺(jué)得這個(gè)問(wèn)題可能不能一概而論，想聽(tīng)一下大家的意見(jiàn)。 謝謝 |
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chemzhh
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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謝謝sobereva對(duì)這兩個(gè)問(wèn)題透徹的回答，我又聯(lián)想到一個(gè)相關(guān)的問(wèn)題。 用晶體結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)作為初始結(jié)構(gòu)或在其基礎(chǔ)上進(jìn)行修改作為初始結(jié)構(gòu)，是一個(gè)好方法嗎，當(dāng)然前提是有類似的晶體結(jié)構(gòu)。 另外文獻(xiàn)中經(jīng)常有報(bào)道將計(jì)算的結(jié)果與晶體結(jié)構(gòu)的鍵長(zhǎng)、鍵角的數(shù)據(jù)進(jìn)行比較，以此說(shuō)明計(jì)算結(jié)果的準(zhǔn)確性，這樣做有意義嗎？ 我聽(tīng)到一種說(shuō)法：晶體結(jié)構(gòu)是堆積之后的結(jié)構(gòu)，會(huì)與單個(gè)分子的結(jié)構(gòu)有差別，當(dāng)然晶體結(jié)構(gòu)是固態(tài)中的結(jié)構(gòu)，而計(jì)算的結(jié)構(gòu)應(yīng)該是在氣相中優(yōu)化的結(jié)果。 期待大家的熱烈討論。 |
8樓2010-10-19 21:04:32
manson1998
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小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
erylingjet(金幣+3):感謝交流！ 2010-10-19 19:49:38
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erylingjet(金幣+3):感謝交流！ 2010-10-19 19:49:38
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如果你的機(jī)器夠牛，就用全模型來(lái)做，計(jì)算方法只要能得到合理的結(jié)果就可以，不需要過(guò)高級(jí)別。 如果你的機(jī)器一般，建議你用簡(jiǎn)化模型來(lái)做，oniom省不了太多時(shí)間，并且說(shuō)服力不夠，還會(huì)遇到一些奇奇怪怪的問(wèn)題。 最主要的還是idea。你隨便翻翻前些年的jpcc jacs om，它們計(jì)算的方法或者說(shuō)模型都很簡(jiǎn)單，但是人家提出了新的機(jī)理或者說(shuō)新的概念。即使你再用超大基組，完整模型重復(fù)一下實(shí)驗(yàn)，得到了一些新的結(jié)果，也是借花獻(xiàn)佛，失去了競(jìng)爭(zhēng)力。 做paper第一是idea，第二是速度。 [ Last edited by manson1998 on 2010-10-18 at 18:26 ] |
2樓2010-10-18 18:20:02
chemzhh
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3樓2010-10-18 19:47:03
zhengpc3505
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4樓2010-10-19 00:37:17
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