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[交流]
【求助/交流】做一個(gè)蛋白質(zhì)晶體的成本是多少？
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| 我有一個(gè)新的家族的一個(gè)蛋白，想測它的三維結(jié)構(gòu)，因?yàn)橐郧皼]有做過，想問問做出一個(gè)蛋白的結(jié)構(gòu)大概要多少錢？我的蛋白小于200個(gè)氨基酸，應(yīng)該也可以用核磁共振來測，不知有沒有人知道分別用X-衍射和核磁共振各需要多少money？ |
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2樓2011-01-06 10:43:48
3樓2011-01-19 10:31:34
段家一凡(金幣+5): 非常感謝 2011-01-26 16:06:12
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偶在生物物理所做結(jié)構(gòu)做了快兩年，簡單說一下我的看法吧 想做結(jié)構(gòu)一般的具有兩個(gè)條件： 1、軟件：是否具備結(jié)構(gòu)生物學(xué)知識。包括晶體學(xué)內(nèi)容和后期結(jié)構(gòu)修正的基礎(chǔ)。這需要有很多專業(yè)軟件去運(yùn)算。軟件的使用和參數(shù)的評估是結(jié)構(gòu)修正中最重要的工作。 2、硬件：包括蛋白質(zhì)純化、結(jié)晶條件搜索、晶體優(yōu)化和最后的衍射。這都需要配套的儀器和試劑。很多試劑適合長期做的買，單獨(dú)做一次買一個(gè)kit太虧，kit也太貴。 然后我們來看你的蛋白。 首先建議在pdb數(shù)據(jù)庫中比對一下，看看有沒有同源蛋白結(jié)構(gòu)已經(jīng)被解析了。不見得是新家族功能上就全新，可能核心區(qū)域很相似。 蛋白小是件好事，一般來說小的會比大的容易一些。 長晶體一般需要大量高純度的具備生物活性目的蛋白，能不能獲得如此高要求的蛋白是第一道門檻。 過了這一關(guān)能不能長出晶體又是一關(guān)，有些人做的順利幾周就能過了這一關(guān)，我屬于不順的人，做了一年多還沒能長出來晶體。 然后是晶體長出來后能不能篩選出來適合衍射條件的晶體又是一個(gè)難度，同樣看運(yùn)氣了。 晶體可以衍射以后確定相角還是一個(gè)難度，如果有同源度較高的蛋白，那么用分子置換法能確定，如果沒有使用重原子或者硒代甲硫氨酸了。 最后是解結(jié)構(gòu)了，還是運(yùn)氣，順了那么三兩下就出來，不順………… 我只對X-ray了解這么多，NMR不了解，請其他人介紹吧。 錢沒法給你估計(jì)。 如果沒有結(jié)構(gòu)生物學(xué)的基礎(chǔ)更加建議尋求合作路線（個(gè)人觀點(diǎn)）。 |
4樓2011-01-19 14:00:17
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