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真菌種屬鑒定 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
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系統(tǒng)發(fā)育樹哪些用于比對(duì)的序列是怎么選擇的，從NCBI數(shù)據(jù)庫直接復(fù)制下來的嗎，選擇原則是什么，是全基因序列嗎？謝謝 ！ |
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2樓2011-08-03 17:20:06
jinkui960
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真菌的鑒定依據(jù)如下： 1）形態(tài)學(xué)特征：菌絲的形態(tài)（有無隔膜）、分生孢子和分生孢子梗的形態(tài)、是否產(chǎn)色素等。 2）生理生化試驗(yàn)：常規(guī)的生理生化試驗(yàn)，可以參考相關(guān)的實(shí)驗(yàn)手冊； 3）分子生物學(xué)鑒定，真菌一般擴(kuò)增保守的ITS序列，測序以后在NCBI中進(jìn)行序列同源性比對(duì)，也可以通過軟件構(gòu)件系統(tǒng)進(jìn)化樹，進(jìn)一步確定真菌的分類地位。 只有通過以上幾個(gè)方面的結(jié)合，才能把一株真菌鑒定到種。 |
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jinzhi20103樓2011-08-03 17:39:11
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系統(tǒng)樹的構(gòu)建，可以參考我剛剛回復(fù)的帖子！ http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=3454662&fpage=1 |
4樓2011-08-03 17:41:02
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