版塊導(dǎo)航: 正在加載中...

登錄注冊

應(yīng)《網(wǎng)絡(luò)安全法》要求，自2017年10月1日起，未進(jìn)行實(shí)名認(rèn)證將不得使用互聯(lián)網(wǎng)跟帖服務(wù)。為保障您的帳號(hào)能夠正常使用，請盡快對帳號(hào)進(jìn)行手機(jī)號(hào)驗(yàn)證，感謝您的理解與支持！

24小時(shí)熱門版塊排行榜

返回列表

當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖

lily_llf

新蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 666.2
散金: 3
紅花: 1
帖子: 57
在線: 25.3小時(shí)
蟲號(hào): 1095362
注冊: 2010-09-10
專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能

[求助] 用AutoDock對接的結(jié)合能較小，可能是什么原因？

求教各位高手：
我用AutoDock 4.2進(jìn)行分子對接，對接的binding energy只有-4到-5kcal/mol，問題可能處在那里呢，要做哪些調(diào)整呢？我看到文獻(xiàn)中的對接能一般在-10kcal/mol左右。一般情況下，對接能達(dá)到什么值才比較有意義？

拜謝！

回復(fù)此樓

» 猜你喜歡

求材料調(diào)劑已經(jīng)有6人回復(fù)
085600材料與化工已經(jīng)有5人回復(fù)
085600材料與化工調(diào)劑 324分已經(jīng)有6人回復(fù)
286求調(diào)劑已經(jīng)有9人回復(fù)
焦慮已經(jīng)有12人回復(fù)
344求調(diào)劑已經(jīng)有6人回復(fù)
266求調(diào)劑已經(jīng)有9人回復(fù)
化學(xué)工程321分求調(diào)劑已經(jīng)有18人回復(fù)
314求調(diào)劑已經(jīng)有8人回復(fù)
08工科 320總分求調(diào)劑已經(jīng)有5人回復(fù)

» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)

» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:

autodock做分子對接，請問re fRMS值代表什么意思，它的大小對結(jié)果有影響嗎？已經(jīng)有1人回復(fù)
用autodock做病毒衣殼蛋白與配體的對接已經(jīng)有7人回復(fù)
autodock使用時(shí)grid打開pdb文件打不開為什么，是不是軟件安裝有問題已經(jīng)有4人回復(fù)
win7可以用autodock嗎已經(jīng)有1人回復(fù)
【急求】Autodock4.2.6 的binding energy和inhib_constant的關(guān)系已經(jīng)有4人回復(fù)
為什么我的 autodock 總是提示找不到或打不開gpf文件？已經(jīng)有3人回復(fù)
使用UNIX進(jìn)行AUTODOCK的對接，不知道有誰做過嗎？已經(jīng)有1人回復(fù)
請教autodock4: non-integral charge及error in docking parameter file 已經(jīng)有2人回復(fù)
autodock前的能量最小哈已經(jīng)有1人回復(fù)
AutoDock、Vina使用中的一些問題已經(jīng)有4人回復(fù)
怎樣以Ref RMS來評價(jià)autodock對接方法的可靠性（重對接法）已經(jīng)有2人回復(fù)
Autodock對接后用什么方法驗(yàn)證，求最快最簡單的方法~ 已經(jīng)有1人回復(fù)
Autodock分子對接后分析已經(jīng)有2人回復(fù)
Autodock 蛋白質(zhì)與藥物對接時(shí)的問題已經(jīng)有2人回復(fù)
請問有沒有用autodock做過蛋白與小肽的對接已經(jīng)有2人回復(fù)
用Autodock做藥物與BSA的對接，有點(diǎn)問題請教已經(jīng)有8人回復(fù)
Autodock對接結(jié)果可信度討論已經(jīng)有8人回復(fù)
Autodock操作過程中的一些疑惑求解答已經(jīng)有2人回復(fù)
用autodock計(jì)算結(jié)合能（結(jié)合oniom方法）已經(jīng)有2人回復(fù)
用AutoDock作分子對接前的小分子能量最小化問題已經(jīng)有6人回復(fù)
AutoDock的安裝？已經(jīng)有7人回復(fù)
【求助】autodock 如何對含金屬化合物的分子做對接已經(jīng)有8人回復(fù)
【求助】200金幣求助autodock中文使用說明書！已經(jīng)有9人回復(fù)
【求助】autodock結(jié)果怎么分析還有怎么來進(jìn)行篩選已經(jīng)有12人回復(fù)
【原創(chuàng)】AutoDock使用筆記總結(jié)－原創(chuàng)始發(fā) 已經(jīng)有32人回復(fù)

1樓 2011-05-24 20:29:14

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

renxudong

木蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 4 (幼兒園)
金幣: 3042.9
散金: 41
紅花: 2
帖子: 844
在線: 144.4小時(shí)
蟲號(hào): 1237010
注冊: 2011-03-18
專業(yè): 樣品前處理方法與技術(shù)

★
ghcacj(金幣+1): 謝謝 2011-07-11 12:20:42

這個(gè)沒什么，只要和實(shí)驗(yàn)的查不到2kcal/mol，你就可以在其中找優(yōu)勢構(gòu)象，

贊一下(1人)

回復(fù)此樓

堅(jiān)持

7樓2011-07-10 21:22:39

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn) 我要訂閱樓主 lily_llf 的主題更新