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[求助]
做分子對接前選擇配體和受體時有什么要求嗎?
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各位牛人,在做分子對接前要從很多配體或者受體中選擇所要的,選擇時有沒有什么原則要遵守呢?比如resolution之類的,或者其他的 謝謝! |
分子對接問題錦集 |
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resolution當(dāng)然是重要的一點了~類似的序列一致性的情況下resolution越高越好,此外,注意一下有配體和無配體的同一蛋白質(zhì)的活性位點結(jié)構(gòu)是否一致,不一致的話可以考慮用結(jié)合配體的,現(xiàn)在很多軟件都是把配體柔性處理的,但是初始結(jié)構(gòu)對對接結(jié)果可能也是有影響的~你可以試試不同的配體初始結(jié)構(gòu) |
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