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[求助]
做分子對接前選擇配體和受體時有什么要求嗎？
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各位牛人，在做分子對接前要從很多配體或者受體中選擇所要的，選擇時有沒有什么原則要遵守呢？比如resolution之類的，或者其他的 謝謝！ |
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5樓2011-06-02 09:25:09
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
御劍江湖(金幣+5): 謝謝 2011-06-01 21:00:36
lily_llf(金幣+2): 謝謝啊！ 2011-06-02 08:16:03
御劍江湖(金幣+5): 謝謝 2011-06-01 21:00:36
lily_llf(金幣+2): 謝謝啊！ 2011-06-02 08:16:03
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resolution當(dāng)然是重要的一點了~類似的序列一致性的情況下resolution越高越好,此外，注意一下有配體和無配體的同一蛋白質(zhì)的活性位點結(jié)構(gòu)是否一致，不一致的話可以考慮用結(jié)合配體的，現(xiàn)在很多軟件都是把配體柔性處理的，但是初始結(jié)構(gòu)對對接結(jié)果可能也是有影響的~你可以試試不同的配體初始結(jié)構(gòu) |
2樓2011-06-01 12:37:40
3樓2011-06-02 08:24:59
4樓2011-06-02 09:02:46
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